456
CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
2.5. L’influence de la température sur les constantes de vitesse.....................................45
2.5.1. Le profil réactionnel ......................................................................................................45
2.5.2. L’équation d’ARRHENIUS..............................................................................................46
2.5.3. Théorie de collision élémentaire...................................................................................47
2.5.4. Théorie de l’état de transition - Théorie de la vitesse absolue.....................................49
2.5.5. Les enzymes stabilisent l’état de transition de la réaction ...........................................53
Problèmes ...................................................................................................................................54
3 – INTRODUCTION À LA CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
RÉACTIONS À UN SUBSTRAT ET UN PRODUIT......................................................................55
3.1. Historique .........................................................................................................................55
3.1.1. La découverte des enzymes...........................................................................................55
3.1.2. Les premières études de la cinétique enzymatique
et le développement du concept du complexe enzyme-substrat ..................................57
3.1.3. Les travaux de Victor HENRI.........................................................................................59
3.1.4. Les problèmes rencontrés par HENRI............................................................................63
3.1.5. La notion de site actif et le mécanisme d’action des enzymes ....................................66
3.2. Description cinétique des réactions enzymatiques
dans des conditions d’équilibre ......................................................................................67
3.2.1. La première équation cinétique : l’équation de HENRI ................................................67
3.2.2. Le traitement de MICHAELIS et MENTEN......................................................................70
3.3. Description cinétique des réactions enzymatiques
dans des conditions d’état stationnaire ......................................................................72
3.3.1. Les premières utilisations de la notion d’état stationnaire...........................................72
3.3.2. Le traitement de BRIGGS et HALDANE..........................................................................73
3.3.3. L’équation de MICHAELIS et MENTEN..........................................................................75
3.3.4. Analyse de la courbe définie par l’équation de MICHAELIS et MENTEN .....................76
3.3.5. Autres formes de l’équation de MICHAELIS et MENTEN ..............................................78
3.3.6. L’équilibre comme un cas particulier de l’état stationnaire.........................................79
3.3.7. Validité et limites de l’hypothèse de l’état stationnaire ...............................................79
3.4. Unités de l’activité enzymatique.....................................................................................81
3.5. Méthodes d’analyse des données cinétiques................................................................82
3.5.1. Le graphique de v en fonction de [A] ...........................................................................82
3.5.2. Différentes méthodes de transformation linéaire .........................................................84
3.6. Les réactions réversibles.................................................................................................96
3.6.1. L’équation de vitesse du mécanisme réversible simple ...............................................96
3.6.2. L’équation de vitesse du mécanisme en trois étapes : traitement à l’équilibre ...........98
3.6.3. La relation de HALDANE..............................................................................................100
3.6.4. L’équation de vitesse du mécanisme en trois étapes : cas à l’état stationnaire.........102
3.6.5. Utilisation du profil d’énergie de GIBBS.....................................................................104
3.6.6. Les enzymes unidirectionnels .....................................................................................104
3.7. Inhibition par le produit .................................................................................................107
3.8. Intégration des équations de vitesse pour les réactions enzymatiques ................108
3.8.1. Équation de MICHAELIS et MENTEN sans inhibition par le produit ...........................108
3.8.2. Inhibition par le produit...............................................................................................109
CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
2.5. L’influence de la température sur les constantes de vitesse.....................................45
2.5.1. Le profil réactionnel ......................................................................................................45
2.5.2. L’équation d’ARRHENIUS..............................................................................................46
2.5.3. Théorie de collision élémentaire...................................................................................47
2.5.4. Théorie de l’état de transition - Théorie de la vitesse absolue.....................................49
2.5.5. Les enzymes stabilisent l’état de transition de la réaction ...........................................53
Problèmes ...................................................................................................................................54
3 – INTRODUCTION À LA CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
RÉACTIONS À UN SUBSTRAT ET UN PRODUIT......................................................................55
3.1. Historique .........................................................................................................................55
3.1.1. La découverte des enzymes...........................................................................................55
3.1.2. Les premières études de la cinétique enzymatique
et le développement du concept du complexe enzyme-substrat ..................................57
3.1.3. Les travaux de Victor HENRI.........................................................................................59
3.1.4. Les problèmes rencontrés par HENRI............................................................................63
3.1.5. La notion de site actif et le mécanisme d’action des enzymes ....................................66
3.2. Description cinétique des réactions enzymatiques
dans des conditions d’équilibre ......................................................................................67
3.2.1. La première équation cinétique : l’équation de HENRI ................................................67
3.2.2. Le traitement de MICHAELIS et MENTEN......................................................................70
3.3. Description cinétique des réactions enzymatiques
dans des conditions d’état stationnaire ......................................................................72
3.3.1. Les premières utilisations de la notion d’état stationnaire...........................................72
3.3.2. Le traitement de BRIGGS et HALDANE..........................................................................73
3.3.3. L’équation de MICHAELIS et MENTEN..........................................................................75
3.3.4. Analyse de la courbe définie par l’équation de MICHAELIS et MENTEN .....................76
3.3.5. Autres formes de l’équation de MICHAELIS et MENTEN ..............................................78
3.3.6. L’équilibre comme un cas particulier de l’état stationnaire.........................................79
3.3.7. Validité et limites de l’hypothèse de l’état stationnaire ...............................................79
3.4. Unités de l’activité enzymatique.....................................................................................81
3.5. Méthodes d’analyse des données cinétiques................................................................82
3.5.1. Le graphique de v en fonction de [A] ...........................................................................82
3.5.2. Différentes méthodes de transformation linéaire .........................................................84
3.6. Les réactions réversibles.................................................................................................96
3.6.1. L’équation de vitesse du mécanisme réversible simple ...............................................96
3.6.2. L’équation de vitesse du mécanisme en trois étapes : traitement à l’équilibre ...........98
3.6.3. La relation de HALDANE..............................................................................................100
3.6.4. L’équation de vitesse du mécanisme en trois étapes : cas à l’état stationnaire.........102
3.6.5. Utilisation du profil d’énergie de GIBBS.....................................................................104
3.6.6. Les enzymes unidirectionnels .....................................................................................104
3.7. Inhibition par le produit .................................................................................................107
3.8. Intégration des équations de vitesse pour les réactions enzymatiques ................108
3.8.1. Équation de MICHAELIS et MENTEN sans inhibition par le produit ...........................108
3.8.2. Inhibition par le produit...............................................................................................109