Chapitre II : Matériel et méthodes
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La distance wij s’obtient par deux principales manières (tab. 2). La première consiste à
incrémenter de 1 la valeur de w entre deux niveaux taxonomiques successifs. Cependant, la
deuxième consiste à standardiser cette distance de manière à ce que cette valeur soit égale à 100
pour deux espèces reliées au niveau taxonomique le plus haut considéré dans l’étude (Clarke et
Warwick, 1999).
Tableau 2 : Valeurs des distances taxonomiques entre deux espèces.
Niveau relatif du lien
entre deux espèces
Distance
taxonomique
même genre, espèce différente
1
même famille, genre différent
2
même ordre, famille différente
3
même classe, ordre différent
4
même embranchement, classe différente
5
même phylum, embranchement différent
6
même règne, phylum différent
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Toutefois, il sera possible de convertir la valeur obtenue par une méthode à l’autre en
utilisant la formule suivante (Merigot, 2008) :
∆𝑏 =
∆𝑎
100/(𝑛𝑜𝑚𝑏𝑟𝑒 𝑑𝑒 𝑛𝑖𝑣𝑒𝑎𝑢𝑥 𝑡𝑎𝑥𝑜𝑛𝑜𝑚𝑖𝑞𝑢𝑒 𝑐𝑜𝑛𝑠𝑖𝑑é𝑟é𝑠 − 1)
Warwick et Clarke (1995) définissent ∆ comme étant la distance taxonomique moyenne
entre chaque paire d’individus tirés au hasard dans l’échantillon. A partir des distances (wij)
incrémentées de 1 entre deux niveaux taxonomiques successifs, ∆ correspond au nombre moyen
de niveaux hiérarchiques dans la classification taxonomique qui séparent deux individus tirés au
hasard appartenant à la même espèce ou à des espèces différentes (Merigot, 2008).
Clarke et Warwick (1998 ; 1995) notent que ∆ est sensible aux espèces dominantes. Par
conséquent, ils ont proposé un indice complémentaire : ∆
*
.
• Distinction taxonomique (∆ * )
Afin de limiter l’influence des espèces dominantes et les individus de la même espèce sur
∆, Warwick et Clarke (1995) ont proposé une forme modifiée de cet indice, qui est ∆
* ou
distinction taxonomique. ∆
* correspond à la distance taxonomique moyenne entre deux
individus tirés au hasard appartenant uniquement à des espèces différentes. Autrement dit, il
mesure l’éloignement taxonomique moyen entre deux individus d’espèces différentes dans un
échantillon :
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