Chapitre II : Matériel et Méthodes
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L'indice de Shannon permet d'exprimer la diversité en prenant en compte le nombre d'espèces et
l'abondance des individus au sein de chacune de ces espèces. Cet indice (H') aura également
tendance à sous-estimer la diversité réelle, en raison de la sous-évaluation systématique des
effectifs spécifiques par échantillon. Il faut donc utiliser les effectifs et poids théoriques ajustés
par des modèles mathématiques choisis pour calculer la densité et la biomasse théorique. Les
formules ayant servi au calcul de l’indice de Shannon s’énoncent comme suit :
ISh (bits) = − ∑ (
Dn í µí±í µí±¡ℎ
DN í µí) log 2 (
Dn í µí±í µí±¡ℎ
DN í µí)
Avec : Dnith : Densités théoriques, DNt : Somme totale des densités théoriques.
ISh (bits) = − ∑ (
Dw í µí±í µí±¡ℎ
DW í µí) log 2 (
Dw í µí±í µí±¡ℎ
DW í µí)
Avec : Dwith : Biomasses théoriques.
DWt : Somme totale de la Biomasses théoriques.
Une communauté dominée par une seule espèce aura un coefficient moindre qu’une communauté
dont toutes les espèces sont codominantes. La valeur de l’indice varie de 0 (une seule espèce, ou
bien une espèce dominant très largement toutes les autres) à log (S) (lorsque toutes les espèces ont
même abondance) (Merigot, 2008).
Selon Iltis (1974 in Daget, 1979) une diversité faible caractérisera un peuplement jeune à haut
pouvoir de multiplication avec dominance nette d’une ou d’un petit nombre d’espèces, alors
qu’une diversité élevée caractérisera au contraire des populations mûres ou séniles présentant une
composition spécifique complexe. L’indice de Shannon est souvent accompagné par l’indice
d’équitabilité.
L’indice d’équitabilité permet de mesurer la répartition des individus au sein des espèces,
indépendamment de la richesse spécifique. Cet indice est un composant complémentaire du
nombre d’espèces car il permet d’envisager le degré d’équirépartition des individus au sein des
espèces. Autrement dit, plus les individus sont répartis également entre les espèces, plus
l’équitabilité est élevée. De façon opposée, si une grande proportion d’individus appartient à une
seule espèce, la dominance est forte et l’équitabilité est faible (Merigot, 2008). Sa valeur varie de
0 (dominance d’une des espèces) à 1 (équirépartition des individus dans les espèces).
L’équitabilité s’obtiendra en divisant l’indice de diversité de Shannon par le logarithme en base 2
de la richesse spécifique.
E =
ISh (bits)
log 2 S (bits)
L'interprétation de la diversité a été réalisée essentiellement à l'aide de cet indice.
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L'indice de Shannon permet d'exprimer la diversité en prenant en compte le nombre d'espèces et
l'abondance des individus au sein de chacune de ces espèces. Cet indice (H') aura également
tendance à sous-estimer la diversité réelle, en raison de la sous-évaluation systématique des
effectifs spécifiques par échantillon. Il faut donc utiliser les effectifs et poids théoriques ajustés
par des modèles mathématiques choisis pour calculer la densité et la biomasse théorique. Les
formules ayant servi au calcul de l’indice de Shannon s’énoncent comme suit :
ISh (bits) = − ∑ (
Dn í µí±í µí±¡ℎ
DN í µí) log 2 (
Dn í µí±í µí±¡ℎ
DN í µí)
Avec : Dnith : Densités théoriques, DNt : Somme totale des densités théoriques.
ISh (bits) = − ∑ (
Dw í µí±í µí±¡ℎ
DW í µí) log 2 (
Dw í µí±í µí±¡ℎ
DW í µí)
Avec : Dwith : Biomasses théoriques.
DWt : Somme totale de la Biomasses théoriques.
Une communauté dominée par une seule espèce aura un coefficient moindre qu’une communauté
dont toutes les espèces sont codominantes. La valeur de l’indice varie de 0 (une seule espèce, ou
bien une espèce dominant très largement toutes les autres) à log (S) (lorsque toutes les espèces ont
même abondance) (Merigot, 2008).
Selon Iltis (1974 in Daget, 1979) une diversité faible caractérisera un peuplement jeune à haut
pouvoir de multiplication avec dominance nette d’une ou d’un petit nombre d’espèces, alors
qu’une diversité élevée caractérisera au contraire des populations mûres ou séniles présentant une
composition spécifique complexe. L’indice de Shannon est souvent accompagné par l’indice
d’équitabilité.
L’indice d’équitabilité permet de mesurer la répartition des individus au sein des espèces,
indépendamment de la richesse spécifique. Cet indice est un composant complémentaire du
nombre d’espèces car il permet d’envisager le degré d’équirépartition des individus au sein des
espèces. Autrement dit, plus les individus sont répartis également entre les espèces, plus
l’équitabilité est élevée. De façon opposée, si une grande proportion d’individus appartient à une
seule espèce, la dominance est forte et l’équitabilité est faible (Merigot, 2008). Sa valeur varie de
0 (dominance d’une des espèces) à 1 (équirépartition des individus dans les espèces).
L’équitabilité s’obtiendra en divisant l’indice de diversité de Shannon par le logarithme en base 2
de la richesse spécifique.
E =
ISh (bits)
log 2 S (bits)
L'interprétation de la diversité a été réalisée essentiellement à l'aide de cet indice.