Chapitre II : Matériel et Méthodes
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composé de groupes zoologiques (Poissons, Mollusques et Crustacés) vivants dans un espace
géographique donné.
Les listes faunistiques établies à partir du dépouillement du listing Thalassa ont permis d’étudier
les peuplements des zones caractéristiques aux deux espèces dans le bassin algérien. La structure
du peuplement a été étudiée à l'aide de la richesse spécifique ainsi que l'indice de diversité
spécifique. Ce dernier a été calculé à partir des valeurs de densité et biomasse observées ajustées
par un modèle de distribution d'abondance adapté. Cela requiert la distribution des abondances
spécifiques et l’emploi, pour représenter celle-ci, d’un modèle mathématique approprié afin de
réduire les biais liés à l’échantillonnage.
2.2.2.1. Richesse spécifique
La richesse spécifique S (Frontier et al., 2008) est représentée par le nombre total des espèces
recensées par unité de surface. Cet indice S peut être utilisé pour analyser la structure taxonomique
du peuplement (ex : nombre d’espèces de polychètes, mollusques, poisson, etc…).
L’abondance, la fréquence, et la densité de chaque espèce ne sont pas prises en considération dans
la définition de la richesse spécifique (Daget, 1979).
La richesse spécifique est sensible à l’effort d’échantillonnage. En effet, le nombre d’espèces
échantillonnées augmente avec l’effort d’échantillonnage, aussi plus sous-estimé l’effort
d’échantillonnage est faible (Magurran, 2004).
2.2.2.2. Diversité spécifique
2.2.2.2.1. Indice de Shannon et Régularité
L’indice de diversité de Shannon renseigne sur la façon dont les individus se répartissent entre
diverses espèces et sur la structure du peuplement dont provient l’échantillon (Daget, 1979).
Le calcul de l’indice de diversité de Shannon Weaver ISh (Daget, 1979) ou H’ (Legendre et
Legendre, 1984 ; Frontier, 1999), se fait à partir des formules suivantes :
ISh (bits) = − ∑ (
qi
Q
) log 2 (
qi
Q
)
Avec :
qi : abondance spécifique.
Q: effectif total du peuplement considéré.
Cet indice (H') aura également tendance à sous-estimer la diversité selon que l'on utilise
l'abondance ou le poids spécifique. En effet, une espèce de faible abondance peut avoir un poids
élevé et inversement. L'Ish doit être aussi déterminé à l'aide de la biomasse :
ISh (bits) = − ∑ (
wi
W
) log 2 (
wi
W
)
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composé de groupes zoologiques (Poissons, Mollusques et Crustacés) vivants dans un espace
géographique donné.
Les listes faunistiques établies à partir du dépouillement du listing Thalassa ont permis d’étudier
les peuplements des zones caractéristiques aux deux espèces dans le bassin algérien. La structure
du peuplement a été étudiée à l'aide de la richesse spécifique ainsi que l'indice de diversité
spécifique. Ce dernier a été calculé à partir des valeurs de densité et biomasse observées ajustées
par un modèle de distribution d'abondance adapté. Cela requiert la distribution des abondances
spécifiques et l’emploi, pour représenter celle-ci, d’un modèle mathématique approprié afin de
réduire les biais liés à l’échantillonnage.
2.2.2.1. Richesse spécifique
La richesse spécifique S (Frontier et al., 2008) est représentée par le nombre total des espèces
recensées par unité de surface. Cet indice S peut être utilisé pour analyser la structure taxonomique
du peuplement (ex : nombre d’espèces de polychètes, mollusques, poisson, etc…).
L’abondance, la fréquence, et la densité de chaque espèce ne sont pas prises en considération dans
la définition de la richesse spécifique (Daget, 1979).
La richesse spécifique est sensible à l’effort d’échantillonnage. En effet, le nombre d’espèces
échantillonnées augmente avec l’effort d’échantillonnage, aussi plus sous-estimé l’effort
d’échantillonnage est faible (Magurran, 2004).
2.2.2.2. Diversité spécifique
2.2.2.2.1. Indice de Shannon et Régularité
L’indice de diversité de Shannon renseigne sur la façon dont les individus se répartissent entre
diverses espèces et sur la structure du peuplement dont provient l’échantillon (Daget, 1979).
Le calcul de l’indice de diversité de Shannon Weaver ISh (Daget, 1979) ou H’ (Legendre et
Legendre, 1984 ; Frontier, 1999), se fait à partir des formules suivantes :
ISh (bits) = − ∑ (
qi
Q
) log 2 (
qi
Q
)
Avec :
qi : abondance spécifique.
Q: effectif total du peuplement considéré.
Cet indice (H') aura également tendance à sous-estimer la diversité selon que l'on utilise
l'abondance ou le poids spécifique. En effet, une espèce de faible abondance peut avoir un poids
élevé et inversement. L'Ish doit être aussi déterminé à l'aide de la biomasse :
ISh (bits) = − ∑ (
wi
W
) log 2 (
wi
W
)