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CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
8.8. Effets isotopiques du solvant ......................................................................................289
Problèmes .................................................................................................................................291
9 – CONTRÔLE DE L’ACTIVITÉ ENZYMATIQUE .............................................................................293
9.1. Fonction des interactions coopératives et allostériques.........................................293
9.1.1. Cycles futiles ...............................................................................................................293
9.1.2. Mécanismes de régulations de l’activité enzymatique...............................................294
9.1.3. Inadéquation de l’équation de MICHAELIS et MENTEN
pour décrire les mécanismes de régulation.................................................................296
9.1.4. La coopérativité ...........................................................................................................297
9.1.5. Interactions allostériques.............................................................................................298
9.2. Le développement de modèle expliquant la coopérativité .........................................299
9.2.1. L’équation de HILL......................................................................................................299
9.2.2. Un autre index de coopérativité ..................................................................................301
9.2.3. Hypothèse d’un équilibre de fixation dans les cinétiques coopératives ...................301
9.2.4. L’équation d’ADAIR ....................................................................................................303
9.2.5. Définitions mécaniques et opérationnelles de la coopérativité..................................307
9.3. Ajustement induit ..........................................................................................................309
9.4. Modèles modernes de coopérativité ............................................................................311
9.4.1. Le modèle symétrique de MONOD, WYMAN et CHANGEUX ......................................311
9.4.2. Le modèle séquentiel de KOSHLAND, NÉMETHY et FILMER......................................318
9.4.3. Modèles association-dissociation................................................................................324
9.5. Coopérativité cinétique..................................................................................................325
Problèmes .................................................................................................................................327
10 – CINÉTIQUES DES SYSTÈMES MULTI-ENZYMATIQUES .....................................................329
10.1. Les enzymes dans leur contexte biologique.................................................................329
10.2. Analyse du contrôle métabolique .................................................................................330
10.3. Elasticités.......................................................................................................................332
10.3.1. Définition de l'élasticité...............................................................................................332
10.3.2. Propriétés communes des élasticités...........................................................................335
10.3.3. Les cinétiques enzymatiques vues à travers l'analyse du contrôle ............................336
10.3.4. Considération des vitesses et des concentrations
comme des effets et non comme des causes...............................................................337
10.4. Les coefficients de contrôle..........................................................................................340
10.5. Relations d'addition.......................................................................................................342
10.6. Relations entre les élasticités et les coefficients de contrôle de flux ....................344
10.6.1. Propriétés de connectivité ...........................................................................................344
10.6.2. Les coefficients de contrôle dans une voie à trois étapes...........................................346
10.6.3. Expression des relations d'addition et de connectivité
sous une forme matricielle ..........................................................................................348
10.6.4. Relation de connectivité pour un métabolite non-impliqué
dans une boucle de contrôle rétroactif ........................................................................348
CINÉTIQUE ENZYMATIQUE
8.8. Effets isotopiques du solvant ......................................................................................289
Problèmes .................................................................................................................................291
9 – CONTRÔLE DE L’ACTIVITÉ ENZYMATIQUE .............................................................................293
9.1. Fonction des interactions coopératives et allostériques.........................................293
9.1.1. Cycles futiles ...............................................................................................................293
9.1.2. Mécanismes de régulations de l’activité enzymatique...............................................294
9.1.3. Inadéquation de l’équation de MICHAELIS et MENTEN
pour décrire les mécanismes de régulation.................................................................296
9.1.4. La coopérativité ...........................................................................................................297
9.1.5. Interactions allostériques.............................................................................................298
9.2. Le développement de modèle expliquant la coopérativité .........................................299
9.2.1. L’équation de HILL......................................................................................................299
9.2.2. Un autre index de coopérativité ..................................................................................301
9.2.3. Hypothèse d’un équilibre de fixation dans les cinétiques coopératives ...................301
9.2.4. L’équation d’ADAIR ....................................................................................................303
9.2.5. Définitions mécaniques et opérationnelles de la coopérativité..................................307
9.3. Ajustement induit ..........................................................................................................309
9.4. Modèles modernes de coopérativité ............................................................................311
9.4.1. Le modèle symétrique de MONOD, WYMAN et CHANGEUX ......................................311
9.4.2. Le modèle séquentiel de KOSHLAND, NÉMETHY et FILMER......................................318
9.4.3. Modèles association-dissociation................................................................................324
9.5. Coopérativité cinétique..................................................................................................325
Problèmes .................................................................................................................................327
10 – CINÉTIQUES DES SYSTÈMES MULTI-ENZYMATIQUES .....................................................329
10.1. Les enzymes dans leur contexte biologique.................................................................329
10.2. Analyse du contrôle métabolique .................................................................................330
10.3. Elasticités.......................................................................................................................332
10.3.1. Définition de l'élasticité...............................................................................................332
10.3.2. Propriétés communes des élasticités...........................................................................335
10.3.3. Les cinétiques enzymatiques vues à travers l'analyse du contrôle ............................336
10.3.4. Considération des vitesses et des concentrations
comme des effets et non comme des causes...............................................................337
10.4. Les coefficients de contrôle..........................................................................................340
10.5. Relations d'addition.......................................................................................................342
10.6. Relations entre les élasticités et les coefficients de contrôle de flux ....................344
10.6.1. Propriétés de connectivité ...........................................................................................344
10.6.2. Les coefficients de contrôle dans une voie à trois étapes...........................................346
10.6.3. Expression des relations d'addition et de connectivité
sous une forme matricielle ..........................................................................................348
10.6.4. Relation de connectivité pour un métabolite non-impliqué
dans une boucle de contrôle rétroactif ........................................................................348