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5 • Techniques et biotechnologies
globale du génome ont permis le développement parallèle des techniques d’analyse de l’ensemble de l’expression des gènes, ensemble qui
est bien entendu spécifique d’un tissu donné, et qui varie selon l’âge, la
thérapeutique… Toutes ces techniques ont en commun une partie
informatique qui fait de la bio-informatique un outil incontournable
en la matière (Tab. 6).
Tableau 6 QUELQUES SITES WEB DE BIOINFORMATIQUE
APPLIQUÉE À LA GÉNÉTIQUE
Genbank et sites associés
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/
http://www. ncbi.nlm.nih.gov//genome/guide/human/
Institute for genomic research (TIGR)
http://www.tigr.org/tdb
human Genome Database
http://www.gdbwww.gdb.org
European Bioinformatics Institute (inclus le site de l’EMBO et Swissprof)
http://www.ebi.ac.uk
RCSB Protein Data Bank
http://www.www.rcsb.org/pdb/
Protein Information Resource (annotation basée sur des séquences d’acide
nucléique qui n’ont pas encore été vérifiées chez l’homme)
http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/searchdb.html/
Swiss-Prot (banque de données des séquences des protéines)
http://www.expasy.org/sitemap.html.ch
Représentations tridimensionnelles
http://ca.expasy.org/cgi-bin/get-sw3d-entry ?PO2836
http://www.rcsb.org/pdb
Biologie modulaire
http://www.ingenuity.com pour Ingenuity Pathways Analysis,
Ingenuity® Systems
Ontology des gènes
http://www.geneontology.org pour Gene Ontology, GO
http://www.kegg.com pour Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,
KEGG
http://www.genecards.org nomenclature des gènes
5 • Techniques et biotechnologies
globale du génome ont permis le développement parallèle des techniques d’analyse de l’ensemble de l’expression des gènes, ensemble qui
est bien entendu spécifique d’un tissu donné, et qui varie selon l’âge, la
thérapeutique… Toutes ces techniques ont en commun une partie
informatique qui fait de la bio-informatique un outil incontournable
en la matière (Tab. 6).
Tableau 6 QUELQUES SITES WEB DE BIOINFORMATIQUE
APPLIQUÉE À LA GÉNÉTIQUE
Genbank et sites associés
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/
http://www. ncbi.nlm.nih.gov//genome/guide/human/
Institute for genomic research (TIGR)
http://www.tigr.org/tdb
human Genome Database
http://www.gdbwww.gdb.org
European Bioinformatics Institute (inclus le site de l’EMBO et Swissprof)
http://www.ebi.ac.uk
RCSB Protein Data Bank
http://www.www.rcsb.org/pdb/
Protein Information Resource (annotation basée sur des séquences d’acide
nucléique qui n’ont pas encore été vérifiées chez l’homme)
http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/searchdb.html/
Swiss-Prot (banque de données des séquences des protéines)
http://www.expasy.org/sitemap.html.ch
Représentations tridimensionnelles
http://ca.expasy.org/cgi-bin/get-sw3d-entry ?PO2836
http://www.rcsb.org/pdb
Biologie modulaire
http://www.ingenuity.com pour Ingenuity Pathways Analysis,
Ingenuity® Systems
Ontology des gènes
http://www.geneontology.org pour Gene Ontology, GO
http://www.kegg.com pour Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,
KEGG
http://www.genecards.org nomenclature des gènes