5.1 Quelques outils de base
101
© Dunod – La photocopie non autorisée est un délit.
Figure 38 Les sondes.
Les sondes génomiques sont des sondes ADN de même structure que le
gène. Par opposition, les sondes ADNc reflètent le contenu spécifique d’un
tissu en ARNm, c’est-à-dire l’expression tissulaire du gène. Elles sont obtenues par transcription inverse. On peut aussi (partie haute du schéma) fabriquer artificiellement (il y a des industriels qui offrent ce service) des
oligonucléotides qui sont des séquences nucléotidiques connues fabriquées
in vitro. Il est assez rare que l’on utilise des sondes couvrant la totalité d’un
gène. Il est plus habituel d’utiliser des inserts, c’est-à-dire des fragments de
plus petite dimension obtenus après coupure au moyen d’enzymes de
restriction (ici EcoRI et HpaII). Les sondes ADNc (« cDNA ») sont obtenues par
transcription inverse à partir de l’ARN messager d’un tissu donné. Elles
comprennent la partie codante des messagers. U est une base spécifique des
ARN, alors que T ne se retrouve que dans l’ADN.