Chapitre 4 • Recherche dans les banques
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Traduction en 6 phases
Figure 4.12 – Les différentes versions des programmes BLAST suivant la
nature de la séquence de départ et du contenu de la banque.
La sensibilité consiste à minimiser le nombre de faux négatifs. Une bonne sensibilité se caractérise par le maximum de « bons » trouvés dans le lot retenu ; elle
est obtenue par un décalage du seuil vers les plus grandes valeurs de E().
La spécificité est la capacité à minimiser le nombre de faux positifs. La spécificité
se caractérise par le fait de n’avoir que des « bons » dans le lot retenu. Pour cela,
le seuil sera décalé vers les faibles valeurs de E().
Compromis sensibilité et spécificité
Figure 4.13 – Sensibilité versus spécificité.
Sensibilité
VP
VP FN
+
--------------------- -
=
Spécificité
VN
VN FP
+
--------------------- -
=