Chapitre 3 • La comparaison de deux séquences
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segment parallèle à cette diagonale indique une répétition interne de longueur 580
(environ la moitié de la longueur de la séquence complète), ce qui est le résultat
d’une duplication en tandem du gène codant pour la protéine initiale.
3.2 MATRICE
SUBSTITUTION
DE
Dans toutes les comparaisons précédentes, ne sont visibles que les résidus identiques
(matrices 1-5) ou les segments identiques (matrice 6). La plupart du temps, le biologiste
Figure 3.8 – Cas de protéines homologues d’ATP synthase mitochondriale
de rat (ATPA_RAT) en Y et de cyanobactérie (ATPA_ANASP) en X.
Figure 3.9 – Cas de faible complexité dans du collagène formant des
fibrilles CAFF_RIFPA (X) vs CAFF_RIFPA (Y).
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segment parallèle à cette diagonale indique une répétition interne de longueur 580
(environ la moitié de la longueur de la séquence complète), ce qui est le résultat
d’une duplication en tandem du gène codant pour la protéine initiale.
3.2 MATRICE
SUBSTITUTION
DE
Dans toutes les comparaisons précédentes, ne sont visibles que les résidus identiques
(matrices 1-5) ou les segments identiques (matrice 6). La plupart du temps, le biologiste
Figure 3.8 – Cas de protéines homologues d’ATP synthase mitochondriale
de rat (ATPA_RAT) en Y et de cyanobactérie (ATPA_ANASP) en X.
Figure 3.9 – Cas de faible complexité dans du collagène formant des
fibrilles CAFF_RIFPA (X) vs CAFF_RIFPA (Y).