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3.1 • Matrice de points
Afin d’augmenter le rapport signal/bruit, on peut considérer qu’il faut un nombre
suffisant de points dans un segment pour être indiqué. Ainsi, si dans la matrice de la
figure 3.5, on met un point si un segment de longueur 3 contient deux identités, on
obtient la matrice de la figure 3.6. Cette notion correspond au filtrage classiquement
utilisé en analyse d’images. En bioinformatique, il s’agit de définir une fenêtre de
calcul (le plus souvent glissante et chevauchante), ici de longueur égale à 3 sur
Figure 3.2 – Cas d’une répétition interne du segment « SEQENCE »
dans deux séquences différentes.
Figure 3.3 – Cas d’une insertion de huit acides aminés (numéros 1 à 8) dans
la séquence horizontale. La séquence «
» a été insérée dans la
ANALYSIS
séquence A ou perdue dans la séquence B.