Chapitre 12 • Détection de sites 3D dans les protéines
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L’approche SuMO trouve aussi de nombre
dans le domaine de
uses applications
l’immunologie et des réactions
s allergies et des maladies
immunologiques croisées, de
auto-immunes. Enfin, ce type d’approche permet aussi l’annotation fonctionnelle de
protéines dont les structures ont été obtenues par des programmes de génomique structurale. L’évolution convergente concerne des protéines ayant évolué à partir d’ancêtres
différents pour aboutir à des propriétés communes voire des fonctions communes. Ce
type d’outil est particulièrement bien adapté à l’analyse de protéines d’évolution convergente. La contrainte majeure de ces approches est qu’il faut disposer des structures 3D.
Figure 12.5 – Inversion dans la séquence des résidus de la triade catalytique.
Figure 12.6 – Sortie du programme SuMo.
Figure 12.7 – Visualisation du site commun détecté.
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