Chapitre 11 • Prédiction de structures 3D
160
Cette approche est rapide et valide si les deux séquences sont très proches et si
l’alignement présente peu d’insertion ou délétion (figure 11.27).
En effet, les réarrangements structuraux à effectuer ne doivent concerner que
quelques résidus afin de rester locaux (réorientations manuelles de chaînes latérales
lors de substitutions). Si le nombre de mutations à effectuer est grand, l’approche par
mutation manuelle devient fastidieuse et introduit une dérive globale dans le modèle
construit. Il faut souligner que cette approche peut aussi être automatisée comme avec
Figure 11.26 – Alignement d’après la superposition des structures 3D.
L’alignement généré à partir de la superposition 3D (voir figure 11.25) des structures présente 24 identités (15 % Id).
Figure 11.27 – Alignement avec MUSCLE des 140 derniers résidus
de FASL_MOUSE avec la séquence de 1TNR-A.
160
Cette approche est rapide et valide si les deux séquences sont très proches et si
l’alignement présente peu d’insertion ou délétion (figure 11.27).
En effet, les réarrangements structuraux à effectuer ne doivent concerner que
quelques résidus afin de rester locaux (réorientations manuelles de chaînes latérales
lors de substitutions). Si le nombre de mutations à effectuer est grand, l’approche par
mutation manuelle devient fastidieuse et introduit une dérive globale dans le modèle
construit. Il faut souligner que cette approche peut aussi être automatisée comme avec
Figure 11.26 – Alignement d’après la superposition des structures 3D.
L’alignement généré à partir de la superposition 3D (voir figure 11.25) des structures présente 24 identités (15 % Id).
Figure 11.27 – Alignement avec MUSCLE des 140 derniers résidus
de FASL_MOUSE avec la séquence de 1TNR-A.