Chapitre 1 • La composition en acides aminés
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Pour identifier la série d’un acide aminé, il suffit de regarder le C avec le H devant
les autres atomes. On doit pouvoir lire « CORN » comme illustré dans la figure 1.1.
Certains acides aminés partagent des propriétés physico-chimiques avec d’autres.
Cela conduit à une distribution des groupes d’acides aminés selon le diagramme
(non exclusif) de Venn schématisé figure 1.3.
Au niveau chimique, les protéines sont obtenues par condensation des acides
aminés et élimination d’eau lors de la formation de la liaison peptidique (pour
chaque acide aminé ajouté). La suite des lettres indiquant l’enchaînement des acides
aminés constitue la séquence de la protéine (on parle aussi de structure primaire).
Chaque séquence caractérise de manière unique une protéine. Une infime partie des
séquences théoriquement possibles existe vraiment. Ce sont celles qui ont été sélectionnées par l’évolution et qui sont douées d’une activité biologique (structurelle et/
ou fonctionnelle).
A
Alanine
Ala
Gly
Ala
Val
Non polaires
C
Cysteine
Cys
D
AsparƟc Acid
Asp
E
Glutamic Acid
Glu
F
Phenylalanine
Phe
G
Glycine
Gly
Leu
Ile
Met
G
Glycine
Gly
H
HisƟdine
His
I
Isoleucine
Ile
K
Lysine
Lys
L
Leucine
Leu
M
Methionine
Met
Phe
Trp
Tyr
AromaƟques
Arg
Chargés posiƟvement
M
Methionine
Met
N
Asparagine
Asn
O
Pyrrolysine
Pyl
P
Proline
Pro
Q
Glutamine
Gln
Lys
Arg
His
Chargés négaƟvement
R
Arginine
Arg
S
Serine
Ser
T
Threonine
Thr
U
Sélénocystéine
Sec
V
Valine
Val
p s
A
u l
G
g
g
Polaires non chargés
W Tryptophane
Trp
Y
Tyrosine
Tyr
p s
A/ n s
A
B
u
lG
/
n
lG
Z
X
Inconnu
Ser
Cys
Thr
Polaires nonchargés
Pro
Glu
X
Inconnu
Pro
Gln
Glu
Sec
Pyl
Figure 1.2 – Correspondance entre CODE 1 lettre, CODE 3 lettres et la
structure chimique des acides aminés trouvés dans les protéines.