5.9 Rôle des communautés biologiques
137
© Dunod – La photocopie non autorisée est un délit.
Plus récemment, on a mis en évidence l’importance du rôle du viroplancton dans la structure et le fonctionnement des réseaux trophiques
aquatiques. En ce qui concerne la diversité spécifique et génétique des
virus, nos connaissances sont encore sommaires et de nombreux progrès
restent à faire, mais leur densité est relativement élevée dans les systèmes
aquatiques (entre 10 4 et 10 8 ml –1 ). Sur le plan fonctionnel, les virus
joueraient trois rôles principaux:
• Agents de mortalité microbienne car ils provoquent la lyse des cellules.
On estime actuellement que les virus sont la cause d’au moins 30%
de la mortalité du bactérioplancton marin.
• Agents régulateurs de la diversité microbienne en milieu aquatique.
L’impact fonctionnel des virus serait particulièrement significatif dans
des processus difficilement quantifiables tels que l’augmentation des
échanges génétiques ou le maintien de la diversité spécifique au sein
des communautés microbiennes. Certains travaux semblent montrer
également que les virus ont un impact plus élevé sur la structure
génétique et la composition spécifique des communautés d’algues
pélagiques, que sur leur abondance.
• Agents de recyclage de la matière organique en milieu pélagique. La
lyse des cellules par les virus s’accompagne d’un enrichissement du
milieu en matières organiques dissoutes qui augmente fortement
l’activité métabolique des bactéries planctoniques non infestées. Il
existe en réalité une boucle fonctionnelle liée à la lyse bactérienne
par les virus (bactéries Æ bactériophages Æ matière organique
dissoute Æ bactéries) qui contribue au recyclage des nutriments dans
les réseaux trophiques microbiens, tout en réduisant la contribution
de la production bactérienne aux flux de matière et d’énergie vers les
niveaux trophiques supérieurs.
5.9.2 Les ripisylves et le fonctionnement des cours d’eau
Les cours d’eau sont des systèmes dynamiques en forte interaction avec
le milieu terrestre environnant. Ils érodent leurs berges et inondent
périodiquement leur lit majeur, ce qui modifie leur physionomie en
créant et en détruisant sur le long terme des bras morts, des bras secondaires et des zones humides. Cette dynamique spatiale et temporelle
est à l’origine de la grande diversité des formations végétales et des
communautés animales de ces zones de contact. La richesse spécifique de
la végétation riveraine autochtone en Europe est comparable à certaines
forêts tropicales humides. Ainsi, on a dénombré 1 400 espèces végétales
sur l’Adour, avec une moyenne de 314 espèces pour 500 m de cours
137
© Dunod – La photocopie non autorisée est un délit.
Plus récemment, on a mis en évidence l’importance du rôle du viroplancton dans la structure et le fonctionnement des réseaux trophiques
aquatiques. En ce qui concerne la diversité spécifique et génétique des
virus, nos connaissances sont encore sommaires et de nombreux progrès
restent à faire, mais leur densité est relativement élevée dans les systèmes
aquatiques (entre 10 4 et 10 8 ml –1 ). Sur le plan fonctionnel, les virus
joueraient trois rôles principaux:
• Agents de mortalité microbienne car ils provoquent la lyse des cellules.
On estime actuellement que les virus sont la cause d’au moins 30%
de la mortalité du bactérioplancton marin.
• Agents régulateurs de la diversité microbienne en milieu aquatique.
L’impact fonctionnel des virus serait particulièrement significatif dans
des processus difficilement quantifiables tels que l’augmentation des
échanges génétiques ou le maintien de la diversité spécifique au sein
des communautés microbiennes. Certains travaux semblent montrer
également que les virus ont un impact plus élevé sur la structure
génétique et la composition spécifique des communautés d’algues
pélagiques, que sur leur abondance.
• Agents de recyclage de la matière organique en milieu pélagique. La
lyse des cellules par les virus s’accompagne d’un enrichissement du
milieu en matières organiques dissoutes qui augmente fortement
l’activité métabolique des bactéries planctoniques non infestées. Il
existe en réalité une boucle fonctionnelle liée à la lyse bactérienne
par les virus (bactéries Æ bactériophages Æ matière organique
dissoute Æ bactéries) qui contribue au recyclage des nutriments dans
les réseaux trophiques microbiens, tout en réduisant la contribution
de la production bactérienne aux flux de matière et d’énergie vers les
niveaux trophiques supérieurs.
5.9.2 Les ripisylves et le fonctionnement des cours d’eau
Les cours d’eau sont des systèmes dynamiques en forte interaction avec
le milieu terrestre environnant. Ils érodent leurs berges et inondent
périodiquement leur lit majeur, ce qui modifie leur physionomie en
créant et en détruisant sur le long terme des bras morts, des bras secondaires et des zones humides. Cette dynamique spatiale et temporelle
est à l’origine de la grande diversité des formations végétales et des
communautés animales de ces zones de contact. La richesse spécifique de
la végétation riveraine autochtone en Europe est comparable à certaines
forêts tropicales humides. Ainsi, on a dénombré 1 400 espèces végétales
sur l’Adour, avec une moyenne de 314 espèces pour 500 m de cours