Premier chapitre : Généralités
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3. Microbiologie des poissons
Normalement la chair du poisson est stérile. Les régions contaminées sont le mucus
qui recouvre la peau, les branchies et le tube digestif (JOFFIN et JOFFIN, 2010).
La contamination bactérienne de la chair ne survient qu’après la capture. Les sources
de cette contamination sont diverses et peuvent être réparties en deux groupes
(ABOTCHI et SEYDI, 2010).
La contamination endogène.
La contamination exogène.
3.1 Contamination endogène ou primaire
La contamination primaire est celle qui survient du vivant de l’animal. Elle se fait via
la respiration, l’alimentation et lors des déplacements. La composition et la quantité
de cette flore bactérienne dépend de l’origine, de la température de l’eau, de
l’alimentation etc. (DELARRAS, 2007).
Certains travaux ont montré une prédominance des bactéries à gram négatif dans la
flore initiale de poissons issus des eaux tempérées (GRAM et DALGAARD, 2002)
alors qu’une proportion élevée de coques à gram positif et de Bacillus sp est trouvée
dans certains poissons provenant des mers chaudes et des eaux tropicales.
Les bactéries d’origine endogène peuvent être subdivisées en 3 classes :
Germes typiquement aquatiques
Ils appartiennent généralement aux genres Pseudomonas, Vibrio,
Flavobacterium,
Halobacterium,
Micrococcus,
Corynebacterium,
Photobacterium, (GUIRAUD, 2003).
Germes d’origine tellurique
Ce sont des bactéries sporulées en particulier les genres Clostridium et
Bacillus. Leur dissémination dans les milieux aquatiques est assurée par les
eaux de ruissellement et les eaux de pluie (GUIRAUD, 2003, ABOTCHI eu
SEYDI, 2010)
Germes de contamination d’origine humaine et/ou animale
Ces germes proviennent du tube digestif de l’homme et des animaux. Ils se
retrouvent dans les milieux aquatiques à la faveur d’une pollution par les eaux
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3. Microbiologie des poissons
Normalement la chair du poisson est stérile. Les régions contaminées sont le mucus
qui recouvre la peau, les branchies et le tube digestif (JOFFIN et JOFFIN, 2010).
La contamination bactérienne de la chair ne survient qu’après la capture. Les sources
de cette contamination sont diverses et peuvent être réparties en deux groupes
(ABOTCHI et SEYDI, 2010).
La contamination endogène.
La contamination exogène.
3.1 Contamination endogène ou primaire
La contamination primaire est celle qui survient du vivant de l’animal. Elle se fait via
la respiration, l’alimentation et lors des déplacements. La composition et la quantité
de cette flore bactérienne dépend de l’origine, de la température de l’eau, de
l’alimentation etc. (DELARRAS, 2007).
Certains travaux ont montré une prédominance des bactéries à gram négatif dans la
flore initiale de poissons issus des eaux tempérées (GRAM et DALGAARD, 2002)
alors qu’une proportion élevée de coques à gram positif et de Bacillus sp est trouvée
dans certains poissons provenant des mers chaudes et des eaux tropicales.
Les bactéries d’origine endogène peuvent être subdivisées en 3 classes :
Germes typiquement aquatiques
Ils appartiennent généralement aux genres Pseudomonas, Vibrio,
Flavobacterium,
Halobacterium,
Micrococcus,
Corynebacterium,
Photobacterium, (GUIRAUD, 2003).
Germes d’origine tellurique
Ce sont des bactéries sporulées en particulier les genres Clostridium et
Bacillus. Leur dissémination dans les milieux aquatiques est assurée par les
eaux de ruissellement et les eaux de pluie (GUIRAUD, 2003, ABOTCHI eu
SEYDI, 2010)
Germes de contamination d’origine humaine et/ou animale
Ces germes proviennent du tube digestif de l’homme et des animaux. Ils se
retrouvent dans les milieux aquatiques à la faveur d’une pollution par les eaux