Chapitre II
Matériel et méthodes
21
3.3.5.2 Méthode de Wavelet (transformation en ondelette)
Elle utilise la décomposition d‟un signal en ondelettes basée sur une fonction oscillatoire
(Lombarte et Tuset, 2005 ; Parisi-Baradad et al., 2005 in Mahé, 2019).
La méthode des ondelettes est utile pour détecter les différences de forme dans des régions
spécifiques, qui pourraient être situées à un angle donné sur le contour de l'otolithe ; en
revanche (Libungan et al., 2015 in Kikuchi et al., 2020).
3.3.5.3 Descripteurs de forme
Ils sont estimés par des formules mathématiques à partir des principales mesures
morphométriques des otolithes (descripteurs de distance étant : longueur antéro-postérieure,
largeur dorso-ventrale, périmètre et aire de l‟otolithe) et sont souvent utilisés de manière
couplée (Mahé, 2019) (tab. 03). Les descripteurs de distance peuvent être obtenus avec
shapeR.
Ces indices permettent de représenter les patrons de forme de l‟otolithe dans un plan à deux
dimensions (Tuset et al., 2003, in Mahé, 2019).
Tableau 03 : Les indices de forme calculés à partir des descripteurs de distance.
Indices de forme
Formules
Ratio d'aspect (AR)
OL / OW
Circularité (C)
OP² / OA
Facteur de forme (FF)
(4πOA) / OP²
Rectangularité (R)
OA / (OL x OW)
Ellipticité (E)
(OL - OW) / (OL + OW)
Roundness (RD)
(4OA) / (πOL²)
OA : aire ; OP : périmètre ; OW : largeur dorso-ventrale ; OL : longueur antéro-postérieure.
Le script d‟application pour l‟extraction des contours, le calcul des descripteurs de forme
(indice de forme et de distance) et du dessin de la forme moyenne des otolithes par les
coefficients de Wavelet et par les coefficients de Fourier est donné dans le script (LakhdarEzzine et Miloudi, 2019) donné dans l’annexe 01.
4. Caractérisation des stocks
Dans cette partie, nous allons étudier la dynamique des stocks identifiés par des méthodes
graphiques et statistiques, afin d‟estimer les paramètres de croissance de l‟équation de von
Bertalanffy.
Matériel et méthodes
21
3.3.5.2 Méthode de Wavelet (transformation en ondelette)
Elle utilise la décomposition d‟un signal en ondelettes basée sur une fonction oscillatoire
(Lombarte et Tuset, 2005 ; Parisi-Baradad et al., 2005 in Mahé, 2019).
La méthode des ondelettes est utile pour détecter les différences de forme dans des régions
spécifiques, qui pourraient être situées à un angle donné sur le contour de l'otolithe ; en
revanche (Libungan et al., 2015 in Kikuchi et al., 2020).
3.3.5.3 Descripteurs de forme
Ils sont estimés par des formules mathématiques à partir des principales mesures
morphométriques des otolithes (descripteurs de distance étant : longueur antéro-postérieure,
largeur dorso-ventrale, périmètre et aire de l‟otolithe) et sont souvent utilisés de manière
couplée (Mahé, 2019) (tab. 03). Les descripteurs de distance peuvent être obtenus avec
shapeR.
Ces indices permettent de représenter les patrons de forme de l‟otolithe dans un plan à deux
dimensions (Tuset et al., 2003, in Mahé, 2019).
Tableau 03 : Les indices de forme calculés à partir des descripteurs de distance.
Indices de forme
Formules
Ratio d'aspect (AR)
OL / OW
Circularité (C)
OP² / OA
Facteur de forme (FF)
(4πOA) / OP²
Rectangularité (R)
OA / (OL x OW)
Ellipticité (E)
(OL - OW) / (OL + OW)
Roundness (RD)
(4OA) / (πOL²)
OA : aire ; OP : périmètre ; OW : largeur dorso-ventrale ; OL : longueur antéro-postérieure.
Le script d‟application pour l‟extraction des contours, le calcul des descripteurs de forme
(indice de forme et de distance) et du dessin de la forme moyenne des otolithes par les
coefficients de Wavelet et par les coefficients de Fourier est donné dans le script (LakhdarEzzine et Miloudi, 2019) donné dans l’annexe 01.
4. Caractérisation des stocks
Dans cette partie, nous allons étudier la dynamique des stocks identifiés par des méthodes
graphiques et statistiques, afin d‟estimer les paramètres de croissance de l‟équation de von
Bertalanffy.