CHAPITRE V
Résultats & Discussion

 

 
 
 
 
 

 
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les cytochromes P450, susceptible d’intervenir dans la dégradation des iso-alcanes afin de
mieux caractériser la microflore bactérienne, et sa capacité de dégradation vis à vis d’une
contamination par les alcanes.
V.11.1.1 Analyses phylogénétiques.
1.PSF-21Sw 100
2.PSF-5S
50.38 100
3.PSF-12Sw 46.93 53.63 100
4.PSF-43Sw 46.67 48.04 56.41 100
5.PSF 6S
55.94 62.63 59.65 54.52 100
6.PSF-26Sw 52.09 50.88 59.46 71.54 63.12 100
7. PSF-31S 48.89 48.12 55.53 66.15 57.99 89.43 100
1
2
3
4
5
6
7
Figure 50. Matrice d’identité (%) des gènes alkB pour les différents isolats ayant produit des
amplicons alkB.
L’homologie la plus importante est trouvée entre les séquences des amplicons des isolats
PSF-31S et PSF-26Sw qui ont tous les deux été identifiés comme M. hydrocarbonoclasticus.
La séquence de l’amplicon alkB de la souche PSF-43Sw (M. nitratireducens) est également
proche de celles des deux précédentes. Alors que la séquence alkB de l’amplicon de PSF21Sw est la plus différentes des autres séquences.
Figure 51. Cladogramme de l’allignement des séquences alkB. La distance génétique est
indiquée à droite.
On constate que les bactéries du genre Marinobacter forment un groupe distinct alors que la
souche PSF-21Sw est la plus éloignée génétiquement des autres.