MATERIEL ET METHODES
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superficielles ou se déroulent des accouplements et meurent juste après la période de
reproduction (NAUSICAA, 2020).
L’analyse du microbiome du tube digestif, des branchies et de la peau chez S. officinalis, faite
par la combinaison de séquençage d’amplicons d’ARNr 16S, de PCR quantitative et
d’imagerie spectrale de fluorescence a révélé un microbiote composé en majeure partie
d’espèces de Vibrionaceae et Piscirickettsiaceae (LUTZ et al, 2019).
II.2 Méthodes
II.2.1 Echantillonnage et isolement des bactéries
Un échantillon de mollusque frais a été prélevé le 12/03/2020 d’une poissonnerie d’Alger.
L’échantillon est déposé directement par le vendeur dans un sac en plastique, ce dernier, est
mis dans une glacière et dirigé au laboratoire de Microbiologie à l’Ecole Nationale Supérieure
des Sciences de la Mer et d'Aménagement du Littoral.
L’échantillon de Sepia officinalis a été manipulé dans des conditions stériles, afin d’effectuer
un isolement des bactéries à partir de son tube digestif selon le protocole d’IDOUI et al.
Modifié (2009) (Figure4).
L’isolement des souches a été effectué sur deux milieux sélectifs : gélose au Cétrimide et
milieu Mac Conkey permettant l’isolement des bactéries à Gram négatif particulièrement
Pseudomonas et les Enterobactéries. A partir des cultures obtenues sur les milieux
d’isolement précédents, un repiquage de deux fois a été effectué sur du BHI A (BRAIN
HEART INFUSION AGAR) pour obtenir des cultures pures. La conservation des souches a
été faite en réalisant un ensemencement par piqure centrale dans des tubes de conservation.
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superficielles ou se déroulent des accouplements et meurent juste après la période de
reproduction (NAUSICAA, 2020).
L’analyse du microbiome du tube digestif, des branchies et de la peau chez S. officinalis, faite
par la combinaison de séquençage d’amplicons d’ARNr 16S, de PCR quantitative et
d’imagerie spectrale de fluorescence a révélé un microbiote composé en majeure partie
d’espèces de Vibrionaceae et Piscirickettsiaceae (LUTZ et al, 2019).
II.2 Méthodes
II.2.1 Echantillonnage et isolement des bactéries
Un échantillon de mollusque frais a été prélevé le 12/03/2020 d’une poissonnerie d’Alger.
L’échantillon est déposé directement par le vendeur dans un sac en plastique, ce dernier, est
mis dans une glacière et dirigé au laboratoire de Microbiologie à l’Ecole Nationale Supérieure
des Sciences de la Mer et d'Aménagement du Littoral.
L’échantillon de Sepia officinalis a été manipulé dans des conditions stériles, afin d’effectuer
un isolement des bactéries à partir de son tube digestif selon le protocole d’IDOUI et al.
Modifié (2009) (Figure4).
L’isolement des souches a été effectué sur deux milieux sélectifs : gélose au Cétrimide et
milieu Mac Conkey permettant l’isolement des bactéries à Gram négatif particulièrement
Pseudomonas et les Enterobactéries. A partir des cultures obtenues sur les milieux
d’isolement précédents, un repiquage de deux fois a été effectué sur du BHI A (BRAIN
HEART INFUSION AGAR) pour obtenir des cultures pures. La conservation des souches a
été faite en réalisant un ensemencement par piqure centrale dans des tubes de conservation.