I.1.11. Les bactéries………………………………………………………………………………..11
I.1.11.1. Les bactéries pathogènes………………………………………………………………...11
I.1.11.2. Les bactéries indicatrices………………………………………………………………...12
I.1.11.2.1. Les coliformes totaux (CT) …………………………………………………………....12
I.1.11.2.2. Les coliformes fécaux (CF) …………………………………………………………...12
I.1.11.2.3. Escherichia coli………………………………………………………………………..13
I.1.11.2.4 Enterococcus………………………………………………………….………………...13
I.1.11.2.5. Salmonella……………………………………………………………………………..14
I.1.12. Contexte réglementaire régissant la production des coquillages…………………………..14
I.2. La résistance aux antibiotiques…………………………………………………….………16
I.2.1. Les antibiotiques…………………………………………………………………………...16
I.2.1.1. Classification et mode d’action………………………………………………………......16
I.2.1.2. Les paramètres d'activité d'un antibiotique…………………………………………........17
I.2.2. Les béta-lactamines………………………………………………………………………...18
I.2.2.1. Définition………………………………………………………………………….……..18
I.2.2.2. Mécanisme d’action des béta-lactamines………………………………………………...18
I.2.2.3. Classification………………………………………………………………………….….18
I.2.2.4. Résistance aux antibiotiques……………………………………………………………..20
I.2.2.4.1. Résistance naturelle………………………………………………………………........20
I.2.2.4.2. Résistance acquise……………………………………………………………………...21
I.2.2.5. Mécanismes de résistances aux β-lactamines………………………………………........21
I.2.2.5.1. L’imperméabilité…………………………………………………………………........21
I.2.2.5.2. Le système d’efflux………………………………………………………………........21
I.2.2.5.3. La modification de la cible…………………………………………………………….21
I.2.2.5.4. Mécanisme enzymatique…………………………………………………………........22
I.2.2.6. La résistance aux antibiotiques en milieu aquatique……………………………………..23
II. MATERIEL ET METHODES
II.1. Présentation de la zone d’étude……………………………………………………………..25
II.2. Contrôle de la qualité microbiologique de la moule et de son milieu d’élevage……….….26
II.2.1. Prélèvement et transport des échantillons……………………………………………..…..26
II.2.2. Analyse des paramètres physico-chimiques……………………………………………....26
II.2.3.Analyse microbiologique…………………………………………………………………..27
II.2.3.1. Analyse microbiologique de la moule…………………………………………………….27
I.1.11.1. Les bactéries pathogènes………………………………………………………………...11
I.1.11.2. Les bactéries indicatrices………………………………………………………………...12
I.1.11.2.1. Les coliformes totaux (CT) …………………………………………………………....12
I.1.11.2.2. Les coliformes fécaux (CF) …………………………………………………………...12
I.1.11.2.3. Escherichia coli………………………………………………………………………..13
I.1.11.2.4 Enterococcus………………………………………………………….………………...13
I.1.11.2.5. Salmonella……………………………………………………………………………..14
I.1.12. Contexte réglementaire régissant la production des coquillages…………………………..14
I.2. La résistance aux antibiotiques…………………………………………………….………16
I.2.1. Les antibiotiques…………………………………………………………………………...16
I.2.1.1. Classification et mode d’action………………………………………………………......16
I.2.1.2. Les paramètres d'activité d'un antibiotique…………………………………………........17
I.2.2. Les béta-lactamines………………………………………………………………………...18
I.2.2.1. Définition………………………………………………………………………….……..18
I.2.2.2. Mécanisme d’action des béta-lactamines………………………………………………...18
I.2.2.3. Classification………………………………………………………………………….….18
I.2.2.4. Résistance aux antibiotiques……………………………………………………………..20
I.2.2.4.1. Résistance naturelle………………………………………………………………........20
I.2.2.4.2. Résistance acquise……………………………………………………………………...21
I.2.2.5. Mécanismes de résistances aux β-lactamines………………………………………........21
I.2.2.5.1. L’imperméabilité…………………………………………………………………........21
I.2.2.5.2. Le système d’efflux………………………………………………………………........21
I.2.2.5.3. La modification de la cible…………………………………………………………….21
I.2.2.5.4. Mécanisme enzymatique…………………………………………………………........22
I.2.2.6. La résistance aux antibiotiques en milieu aquatique……………………………………..23
II. MATERIEL ET METHODES
II.1. Présentation de la zone d’étude……………………………………………………………..25
II.2. Contrôle de la qualité microbiologique de la moule et de son milieu d’élevage……….….26
II.2.1. Prélèvement et transport des échantillons……………………………………………..…..26
II.2.2. Analyse des paramètres physico-chimiques……………………………………………....26
II.2.3.Analyse microbiologique…………………………………………………………………..27
II.2.3.1. Analyse microbiologique de la moule…………………………………………………….27
