Généralités
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I.1.11.2.3. Escherichia coli
Coliforme fécale qui produit de l’indole à partir du tryptophane à 44°C ± 0.2°C. La
présence d’Escherichia coli dans une eau (comme dans un aliment) représente le meilleur
indice de contamination fécale d’origine humaine ou animale. En effet, E.coli ne fait pas partie
de la flore microbienne du sol et des eaux, mais de celle de la partie terminale du tube digestif
de l’homme et des animaux à sang chaud. Cependant, c’est un germe très sensible aux
conditions hostiles de l’environnement. Il est considéré comme un très bon indicateur de
contamination fécale récente (OMS, 2000 ; Rodier, 2005).
I.1.11.2.4 Enterococcus
La classification générale des Streptocoques fécaux a été modifiée dans les années 80 par la
création d’un nouveau genre, Enterococcus parmi les espèces appartenant antérieurement au
genre Enterococcus de groupe sérologique D de la classification de Lancefield. Enteroccus
faecalis et Enterococcus faecium sont les deux espèces les plus souvent identifiées chez
l’humain (Clausen et al., 1977 ; Gleeson et Gray, 1997 in Chevalier, 2003). Quant aux
Streptocoques du groupe D susceptibles de contaminer les eaux d’approvisionnement, ils sont
plutôt typiques des déjections animales, comme Streptococcus bovis, S. gallolyticus et S.
alactolyticus.
L’intérêt à l’égard des entérocoques s’explique par le fait que, comparativement aux
coliformes, ils sont plus résistants à des conditions environnementales difficiles et persistent
plus longtemps dans l’eau (Chevalier, 2003).
Buttiaux (1958) a souligné l’intérêt de l’association « Escherichia coli Enterococcus
faecalis » dans la recherche des contaminations alimentaires. Ces germes, hôtes habituels de
l’intestin de l’homme et des animaux, constituent un excellent indice de souillure fécale.
L’entérocoque a une durée de vie nettement plus longue que les coliformes. D’une manière
générale, on peut dire que pour une charge microbienne donnée, le nombre des Streptocoques
fécaux est généralement plus faible que celui d’Escherichia coli et dans des conditions de
sédimentation favorables, l’entérocoque disparaît plus vite qu’Escherichia coli de la couche
d’eau superficielle, mais subsiste longtemps sur le fond.