Chapitre II : Matériel et méthodes
-26moléculaire comme une partie de la taxonomie et rejette l’idée que l’identification en utilisant
l’ADN remplacera la taxonomie basée sur les caractères divers (Schindel et Miller, 2005).
Parmi les bases de données qui existent, le Barcode Of Life Data System (BOLD,
http://www.boldsystems.org/) qui facilite l’acquisition, le stockage, l’analyse et la publication des
enregistrements de barcode, il est librement accessible à tout chercheur ayant des intérêts dans le
barcode moléculaire (Ratnasingham and Hebert, 2007).
4.3. Systématique phylogénétique
La phylogénie est la discipline ayant pour objectif l’étude des relations de parenté entre les
organismes ou les taxons (Lecointre et Le Guyader, 2001).
En phylogénie, les relations évolutives entre les objets étudiés sont représentées par des arbres
phylogénétiques ou dendrogrammes.
Les arbres phylogénétiques (fig. 2.4) sont des graphes connexe non cyclique (il n’est pas un réseau),
qui expriment les liens entre les taxons sous forme d’une succession de branchements, il comporte
des liens (branches) qui relient entre eux des sommets.
Les sommets sont des unités taxonomiques, ils peuvent être ;
 Internes, ils sont appelés des nœuds et représentent UTHs ou unités taxonomiques
hypothétiques.
 Externe, ils sont appelés des feuilles et représentent des UTOs ou unités taxonomiques
opérationnelles
Figure 2.4: Structure d'un arbre phylogénétique
Les branches représentent les relations de parentés entre les unités taxonomiques, on distingue des
branches internes et externes.
Selon la méthode qui préside à leur construction, les arbres ont différents noms :
 Le dendrogramme est neutre et ne désigne rien qu’un arbre.