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Complexes macrocycliques. Cryptates
En effet, la gramicidine S ne forme pas de complexes avec les cations
alcalins (1 16a). Cette absence de propriétés complexantes peut paraître
surprenante si l’on compare ce composé à I’antamanide qui est aussi un
cyclodécapeptide et qui, comme nous venons de le voir, complexe fortement
les cations alcalins. Cette différence radicale entre ces deux cyclopeptides
mérite un commentaire.
Dans le premier chapitre consacré aux complexes de macrocycles synthétiques nous avons vu que la taille du macrocycle est d’une importance
primordiale; c’est elle qui détermine largement le type de complexe obtenu.
Pour les macrocycles naturels ce terme joue toujours un rôle non négligeable,
mais son importance est pondérée par d’autres facteurs, plus particulièrement
par les liaisons hydrogène.
La structure de la gramicidine S (Fig. 2.23b) révèle un important réseau
de liaisons hydrogène intramoléculaires qui stabilisent très fortement la
conformation du macrocycle (1 16b). I1 est probable que l’absence de
propriétés complexantes soit liée à cette conformation très stabilisée, car la
formation d’un complexe nécessiterait la rupture de ces quatre liaisons
hydrogène (1 I5a).
2.4.3 Cyclopeptides synthétiques
Nous avons déjà signalé dans la première partie l’importance jouée par
les cyclopeptides dans la compréhension des états conformationnels des
protéines (( linéaires ». Un aspect complémentaire de ces investigations est
l’étude des éventuelles propriétés complexantes de ces composés.
Une autre approche consiste à synthétiser, sur la base de composés
cycliques naturels, des analogues cyclopeptidiques.
La synthèse et l’étude des cyclopeptides répondent donc à des motivations
multiples, d’où l’intérêt porté par un grand nombre de laboratoires à ces
substances. Nous n’aborderons que très brièvement ce vaste domaine.
a) Cyclo-(L-Pro-Gly)3
L’enchaînement Pro-Gly est très abondant dans les protéines (collagène,
élastine). L’association de ces deux amino-acides (ayant chacun, comme nous
l’avons signalé plus haut, des propriétés très particulières : rigidité du cycle
à 5 atomes; faible différence d’énergie entre les formes cis et trans de la
liaison peptidique formée avec l’azote de la proline ; faible encombrement
stérique de la glycine) confère au niveau de leur localisation des caractéristiques spécifiques comme le changement de direction (retour de la chaîne).
L’importance du couple Pro-Gly a donc motivé son incorporation dans des
systèmes cycliques comme, par exemple, le cyclo (L-Pro-Gly)3 ( I 17a).
La spectroscopie RMN et le dichroïsme circulaire ont montré l’existence
de plusieurs conformères suivant la nature du solvant. Le cyclopeptide a une
symétrie C3 dans les solvants non polaires, avec des liaisons peptidiques trans
Complexes macrocycliques. Cryptates
En effet, la gramicidine S ne forme pas de complexes avec les cations
alcalins (1 16a). Cette absence de propriétés complexantes peut paraître
surprenante si l’on compare ce composé à I’antamanide qui est aussi un
cyclodécapeptide et qui, comme nous venons de le voir, complexe fortement
les cations alcalins. Cette différence radicale entre ces deux cyclopeptides
mérite un commentaire.
Dans le premier chapitre consacré aux complexes de macrocycles synthétiques nous avons vu que la taille du macrocycle est d’une importance
primordiale; c’est elle qui détermine largement le type de complexe obtenu.
Pour les macrocycles naturels ce terme joue toujours un rôle non négligeable,
mais son importance est pondérée par d’autres facteurs, plus particulièrement
par les liaisons hydrogène.
La structure de la gramicidine S (Fig. 2.23b) révèle un important réseau
de liaisons hydrogène intramoléculaires qui stabilisent très fortement la
conformation du macrocycle (1 16b). I1 est probable que l’absence de
propriétés complexantes soit liée à cette conformation très stabilisée, car la
formation d’un complexe nécessiterait la rupture de ces quatre liaisons
hydrogène (1 I5a).
2.4.3 Cyclopeptides synthétiques
Nous avons déjà signalé dans la première partie l’importance jouée par
les cyclopeptides dans la compréhension des états conformationnels des
protéines (( linéaires ». Un aspect complémentaire de ces investigations est
l’étude des éventuelles propriétés complexantes de ces composés.
Une autre approche consiste à synthétiser, sur la base de composés
cycliques naturels, des analogues cyclopeptidiques.
La synthèse et l’étude des cyclopeptides répondent donc à des motivations
multiples, d’où l’intérêt porté par un grand nombre de laboratoires à ces
substances. Nous n’aborderons que très brièvement ce vaste domaine.
a) Cyclo-(L-Pro-Gly)3
L’enchaînement Pro-Gly est très abondant dans les protéines (collagène,
élastine). L’association de ces deux amino-acides (ayant chacun, comme nous
l’avons signalé plus haut, des propriétés très particulières : rigidité du cycle
à 5 atomes; faible différence d’énergie entre les formes cis et trans de la
liaison peptidique formée avec l’azote de la proline ; faible encombrement
stérique de la glycine) confère au niveau de leur localisation des caractéristiques spécifiques comme le changement de direction (retour de la chaîne).
L’importance du couple Pro-Gly a donc motivé son incorporation dans des
systèmes cycliques comme, par exemple, le cyclo (L-Pro-Gly)3 ( I 17a).
La spectroscopie RMN et le dichroïsme circulaire ont montré l’existence
de plusieurs conformères suivant la nature du solvant. Le cyclopeptide a une
symétrie C3 dans les solvants non polaires, avec des liaisons peptidiques trans