Ionophores macrocycliques naturels
235
Les différences se situent au niveau de l’orientation des groupes Phe
(Figs. 2.20, 2.21) et Cha (Fig. 2.22) par rapport à l’entité macrocyclique. Dans
le cas des résidus Phe, les groupes phényle sont en quelque sorte plaqués
contre le squelette macrocyclique ce qui confère à l’ensemble un caractère
lipophile marqué (Fig. 2.20). Dans le cas des résidus Cha les groupes
cyclohexyle sont fortement écartés du macrocycle, ce qui laisse la partie
centrale (polaire) très accessible aux interactions avec le milieu extérieur.
Cette accessibilité entraîne :
- la formation d’un second complexe avec Li+ qui fixe plusieurs molécules
d’eau,
- la formation de sept liaisons hydrogène (4 liaisons NH---Br-, 3 liaisons
Toutes ces interactions ont pour conséquence la disparition du caractère
lipophile de ce complexe et de ce fait, empêchent sa fixation sur la partie
lipophile de la membrane, d’où perte de l’activité antitoxique. Rappelons que
le mécanisme de protection postulé est la fixation de I’antamanide sur le site
récepteur de la phalloïdine.
C = O---HOH).
2.4.2 Gramicidine S
Un autre cyclodécapeptide naturel, la gramicidine S (Fig. 2.23a), présente
aussi des propriétés antibiotiques, mais celles-ci ne sont pas liées à des
propriétés de complexation ou de transport de cations.
L- Val
L - Pro
I
O - Phe- L - Leu- O -Phe
L- Pro
L-Vai
1
I
I
L - Orn
i b l
Figure 2.23 Structure de la gramicidine S. La figure b montre les quatre liaisons
hydrogène qui stabilisent la conformation du macrocycle.
235
Les différences se situent au niveau de l’orientation des groupes Phe
(Figs. 2.20, 2.21) et Cha (Fig. 2.22) par rapport à l’entité macrocyclique. Dans
le cas des résidus Phe, les groupes phényle sont en quelque sorte plaqués
contre le squelette macrocyclique ce qui confère à l’ensemble un caractère
lipophile marqué (Fig. 2.20). Dans le cas des résidus Cha les groupes
cyclohexyle sont fortement écartés du macrocycle, ce qui laisse la partie
centrale (polaire) très accessible aux interactions avec le milieu extérieur.
Cette accessibilité entraîne :
- la formation d’un second complexe avec Li+ qui fixe plusieurs molécules
d’eau,
- la formation de sept liaisons hydrogène (4 liaisons NH---Br-, 3 liaisons
Toutes ces interactions ont pour conséquence la disparition du caractère
lipophile de ce complexe et de ce fait, empêchent sa fixation sur la partie
lipophile de la membrane, d’où perte de l’activité antitoxique. Rappelons que
le mécanisme de protection postulé est la fixation de I’antamanide sur le site
récepteur de la phalloïdine.
C = O---HOH).
2.4.2 Gramicidine S
Un autre cyclodécapeptide naturel, la gramicidine S (Fig. 2.23a), présente
aussi des propriétés antibiotiques, mais celles-ci ne sont pas liées à des
propriétés de complexation ou de transport de cations.
L- Val
L - Pro
I
O - Phe- L - Leu- O -Phe
L- Pro
L-Vai
1
I
I
L - Orn
i b l
Figure 2.23 Structure de la gramicidine S. La figure b montre les quatre liaisons
hydrogène qui stabilisent la conformation du macrocycle.