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Les biomarqueurs moléculaires en oncologie
Réarrangements du génome
Des anomalies de la méiose, plus rarement de la mitose, peuvent conduire
à des réarrangements importants du génome. Les trisomies sont les réarrangements les plus fréquents, avec des conséquences pathologiques majeures. Des
délétions et des insertions de segments chromosomiques surviennent lors de
phénomènes de recombinaison homologue ou de transposition. La duplication de certains gènes peut survenir dans la lignée germinale, au cours de la
méiose, mais l’amplification, qui conduit à la multiplication parfois considérable du nombre de copies d’un gène, ne survient généralement que dans des
lignées somatiques et s’observe dans les cellules cancéreuses. Enfin, les translocations chromosomiques, dues à une recombinaison inégale entre séquences
homologues dans deux chromosomes différents, s’observent également dans les
cancers, tout particulièrement les leucémies.
Biomarqueurs et génome constitutionnel
Le génome de l’hôte représente ainsi une source d’informations capitale
pour le diagnostic et le pronostic des cancers, tant pour la recherche de mutations germinales expliquant les syndromes de prédisposition aux cancers, que
pour la recherche de polymorphismes associés à l’évolution de la maladie ou aux
effets des traitements. Les mutations germinales des gènes BRCA1 et BRCA2
sont recherchées de façon systématique dans les cancers du sein dont la présentation clinique évoque l’existence d’un syndrome de prédisposition familiale,
celles de gènes impliqués dans la réparation des mésappariements, en particulier MLH1 et MSH2, dans les cancers du côlon évocateurs eux aussi d’une
prédisposition familiale [9]. En revanche, la recherche de polymorphismes
susceptibles de guider le choix des agents anticancéreux n’est pas encore passée
en routine, malgré l’existence d’associations très fortes entre certains de ces
polymorphismes et la toxicité de médicaments d’usage fréquent [10].
Génome tumoral
Caractères généraux
Alors que les polymorphismes génétiques sont des variations constitutionnelles qui sont présentes à une fréquence appréciable dans les populations humaines, les mutations somatiques des tumeurs sont des événements
caractéristiques des cancers. On sait, depuis le travail pionnier de l’équipe
de Weinberg [11], que trois événements oncogéniques au moins sont néces-
Les biomarqueurs moléculaires en oncologie
Réarrangements du génome
Des anomalies de la méiose, plus rarement de la mitose, peuvent conduire
à des réarrangements importants du génome. Les trisomies sont les réarrangements les plus fréquents, avec des conséquences pathologiques majeures. Des
délétions et des insertions de segments chromosomiques surviennent lors de
phénomènes de recombinaison homologue ou de transposition. La duplication de certains gènes peut survenir dans la lignée germinale, au cours de la
méiose, mais l’amplification, qui conduit à la multiplication parfois considérable du nombre de copies d’un gène, ne survient généralement que dans des
lignées somatiques et s’observe dans les cellules cancéreuses. Enfin, les translocations chromosomiques, dues à une recombinaison inégale entre séquences
homologues dans deux chromosomes différents, s’observent également dans les
cancers, tout particulièrement les leucémies.
Biomarqueurs et génome constitutionnel
Le génome de l’hôte représente ainsi une source d’informations capitale
pour le diagnostic et le pronostic des cancers, tant pour la recherche de mutations germinales expliquant les syndromes de prédisposition aux cancers, que
pour la recherche de polymorphismes associés à l’évolution de la maladie ou aux
effets des traitements. Les mutations germinales des gènes BRCA1 et BRCA2
sont recherchées de façon systématique dans les cancers du sein dont la présentation clinique évoque l’existence d’un syndrome de prédisposition familiale,
celles de gènes impliqués dans la réparation des mésappariements, en particulier MLH1 et MSH2, dans les cancers du côlon évocateurs eux aussi d’une
prédisposition familiale [9]. En revanche, la recherche de polymorphismes
susceptibles de guider le choix des agents anticancéreux n’est pas encore passée
en routine, malgré l’existence d’associations très fortes entre certains de ces
polymorphismes et la toxicité de médicaments d’usage fréquent [10].
Génome tumoral
Caractères généraux
Alors que les polymorphismes génétiques sont des variations constitutionnelles qui sont présentes à une fréquence appréciable dans les populations humaines, les mutations somatiques des tumeurs sont des événements
caractéristiques des cancers. On sait, depuis le travail pionnier de l’équipe
de Weinberg [11], que trois événements oncogéniques au moins sont néces-