154 Les biomarqueurs moléculaires en oncologie
Tableau I - Différentes techniques de digital PCR
Fabricant
Technique
Volume
de l’échantillon
Nombre d’échantillons
qPCR
Précision
Multiplexage
Bio-Rad
QX200™ Droplet Digital™
PCR System
– 20 μl
– 1-8 échantillons/cartouche
– 1-96 échantillons/run
– 20 000 gouttelettes par
échantillon
Non
+/– 10 %
Oui 
– Utilisation de 2 couleurs
– Détection
possibles
de 2 mutations
RainDance
Technologies
RainDrop™ Digital PCR
System
– 5-50 μl
– 8 échantillons par run (5 millions
de gouttelettes par minute)
– 10 7
gouttelettes par échantillon
– 8
= 10 7
gouttelettes par run
Non
Détection :
1mutant/25
= 10 4
wildtype
Limite de détection :
1/10 6
Oui
– Utilisation de 2 couleurs
(avec possibilité de faire
varier la concentration
des sondes)
– Détection possible
de 10 mutations
IRCM
Intplex
– 1 ml de Plasma
– 5 μl d’ADN extrait
Plaque 96 puits
Oui
< 0,01 %
Oui
– Détection possible de 1
à 10 mutations
Sysmex
BEAMing
– Echantillon initial
de sérum/plasma:
0,5 ml-4 ml
Plaque 96 puits
(5 puits contenant chacun 100μl
d’émulsion)
– Diamètre billes : 1μm
– Compartiment de PCR :
Ædiamètre : 3-10 μm
Æ volume : 15-400 fl
Non
< 0,1 %
Oui
– Détection possible
de 10 mutations
Life
technologies
QuantStudio™ 12K Flex
System
– Plaque 96 puits :
10-100 μl
– Plaque 384 puits :
5-20 μl
Plaque 96 puits : 10-100 μl
Plaque 384 puits : 5-20 μl
Oui
< 1 copie
Oui
– Utilisation de 2 couleurs
– Détection
possibles
de 2 mutations
Fluidigm
Corporation
– Digital PCR Biomark
HD 48.770 digital Array
IFC
– Digital PCR EP1 48.770
Digital Array IFC
– 8 μl d’échantillon
minimum
48 entrées par puce
Oui
1 copie/0,85 nl
de réaction
Oui
– Utilisation de 5 couleurs
– Détection possible
de 5 mutations