Exemple 6.12
Pour synthétiser le dipeptide ProOPhe, un chimiste prépare une solution contenant un mélange équimolaire de
proline (Pro) et de phénylalanine (Phe), et décide de chauffer le tout. Son approche sera-t-elle couronnée de succès ?
Solution
Les acides aminés peuvent réagir comme une amine ou un acide carboxylique, puisqu’il n’y a aucun groupement protecteur.
Chaque acide aminé peut donc réagir avec lui-même comme avec le deuxième acide aminé. Un mélange de dipeptides sera
produit et formé de ProOPro, ProOPhe, PheOPhe et PheOPro. Les dipeptides synthétisés auront encore un groupement
amino et un groupement carboxyle libres, ce qui pourra ensuite occasionner la formation de trimères, de tétramères, de
pentamères, etc. (mélange complexe).
6.8.1 Protections et déprotections des acides aminés
Les groupements protecteurs doivent être choisis judicieusement de façon que leur
incorporation et leur retrait n’affectent pas d’autres groupements protecteurs ou les
liaisons peptidiques. Les acides carboxyliques sont souvent protégés sous forme d’esters
en utilisant des conditions acides, lesquels peuvent être reconvertis en acide carboxy lique
par une hydrolyse avec NaOH. Pour les groupements amines, plusieurs groupements
protecteurs ont été mis au point, notamment les groupements N-benzyloxycarbonyle
(N-Cbz), N-t-butyloxycarbonyle (N-Boc) et N-uorénylméthyloxycarbonyle (N-Fmoc).
Chacun de ces groupements protecteurs peut être enlevé en utilisant des conditions
réactionnelles spéciques. Le groupe N-Cbz peut être déprotégé par une hydrogénolyse
(H 2 , Pd/C), le groupe N-Boc par un traitement avec l’acide triuoroacétique (ou TFA)
dans le CH 2 Cl 2 et le groupe N-Fmoc par un traitement avec une base faible (pipéridine
dans le diméthylformamide (DMF)). Les gures 6.39 et 6.40 montrent les conditions
requises pour l’incorporation et l’enlèvement de ces groupements protecteurs sur un
acide aminé de structure générale (R étant la chaîne latérale).
Figure 6.39 Groupements protecteurs pour les fonctions amines des acides aminés
294 Chapitre 6 Protides
Pour synthétiser le dipeptide ProOPhe, un chimiste prépare une solution contenant un mélange équimolaire de
proline (Pro) et de phénylalanine (Phe), et décide de chauffer le tout. Son approche sera-t-elle couronnée de succès ?
Solution
Les acides aminés peuvent réagir comme une amine ou un acide carboxylique, puisqu’il n’y a aucun groupement protecteur.
Chaque acide aminé peut donc réagir avec lui-même comme avec le deuxième acide aminé. Un mélange de dipeptides sera
produit et formé de ProOPro, ProOPhe, PheOPhe et PheOPro. Les dipeptides synthétisés auront encore un groupement
amino et un groupement carboxyle libres, ce qui pourra ensuite occasionner la formation de trimères, de tétramères, de
pentamères, etc. (mélange complexe).
6.8.1 Protections et déprotections des acides aminés
Les groupements protecteurs doivent être choisis judicieusement de façon que leur
incorporation et leur retrait n’affectent pas d’autres groupements protecteurs ou les
liaisons peptidiques. Les acides carboxyliques sont souvent protégés sous forme d’esters
en utilisant des conditions acides, lesquels peuvent être reconvertis en acide carboxy lique
par une hydrolyse avec NaOH. Pour les groupements amines, plusieurs groupements
protecteurs ont été mis au point, notamment les groupements N-benzyloxycarbonyle
(N-Cbz), N-t-butyloxycarbonyle (N-Boc) et N-uorénylméthyloxycarbonyle (N-Fmoc).
Chacun de ces groupements protecteurs peut être enlevé en utilisant des conditions
réactionnelles spéciques. Le groupe N-Cbz peut être déprotégé par une hydrogénolyse
(H 2 , Pd/C), le groupe N-Boc par un traitement avec l’acide triuoroacétique (ou TFA)
dans le CH 2 Cl 2 et le groupe N-Fmoc par un traitement avec une base faible (pipéridine
dans le diméthylformamide (DMF)). Les gures 6.39 et 6.40 montrent les conditions
requises pour l’incorporation et l’enlèvement de ces groupements protecteurs sur un
acide aminé de structure générale (R étant la chaîne latérale).
Figure 6.39 Groupements protecteurs pour les fonctions amines des acides aminés
294 Chapitre 6 Protides