Pour le passage du tex te e n ARN au
tex te e n ac ides aminés, la mac hine
s ' ap pe lle ribosome et le dé but du tex te
à trad uire co mme nce par auget pa rfo is
gug o u uug et finit in va ri abl e me nt pa r
11ag. 11ga o u uaa. Systé matique me nt ,
les triple ts de lettres d ' ARN vo nt
être transformés e n une le ttre d ' ac ide
aminé. On o bserve là des phé no mè nes
très di ffé re nts de ce qui se passe
e n c himie c lass ique : de vé ritabl es
codes sont inte rprétés de maniè re
rigoure use da ns la cellul e. Autre
exemple de mac hine e n ac ti o n sur
les ce llul es germin a les o u les ce llul es
cancéreuses, les télomérases. Il s ' ag it
d ' un assembl age de proté ines et
d ' ARN c hargé d ' ajo ute r un e séque nce
ré pétée spéc ifique à l'ex tré mité des
chro mosomes, po ur év ite r de pe rdre
des gènes lo rs de le ur ré plicati o n po ur
produire de no uve ll es ce llules.
Il reste e ncore de te lles machines à
découvrir au cœur des ce llules. Pa rmi
les découvertes réce ntes, évoquo ns
juste les structures de CRIS PR , au
no m improbable mai s do nt l' ex iste nce
est e ncore plu s surpre nante : o n
tro uve dans bo n no mbre de bactéri es
des séri es de mots courts ré pétés qui
fo rment une ossature dans laque ll e
vo nt s' inte rcale r d 'autres mo ts très
di ffé re nts, qui sembl e nt issus d ' une
lang ue étrangère à la bacté ri e. En
fa it , to ut comme no us, les bacté ri es
sont suje ttes à des attaques de virus
et cette structure se compo rte comme
un e nsemble de cases mé mo ires , q ui
reti e nne nt des mo rceaux de séque nces
de viru s re ncontrés et les reconnai ssent
lo rs de futures attaques: ce n' est ni plu s
ni mo in s qu ' un systè me immunita ire
auq ue l sont assoc iés un e nsemble de
mo ts et une mac hineri e spéc ifique de
gènes assoc iés.
De faço n c la ire et re marquable , les
mo ts a in si que le ur assembl age e t
le ur interpré tati o n par des machines
spéc ia li sées jo ue nt un rô le prédo mina nt
da ns les cellules vivantes. Au-de là des
phé no mè nes de the rmod yna mique,
d 'électrostatique
o u
autres
lo is
à caractè re continu , il ex iste des
re prése ntati o ns et des compo rte me nts
de nature sy mbo lique qui contrô le nt le
devenir des ce llul es.
langages, structures et interactions
Des mots qui s 'e nchaî ne nt de façon
contrô lée, y aurait- il do nc un langage,
vo ire des langages à l' œ uvre dans
les o rgani smes ? Précisons les te rmes
e mp loyés : il y a géné rale me nt de ux
niveaux d 'écriture dans une lang ue, le
Dans un ARN : télomérase.
Une structure de pseudo-nœud dans la partie ARN
de la télomérase humaine : cette structure permet de
positionner une matrice qui va générer des répétitions
TT ACCC à la fin des chromosomes et éviter le
raccourcissement de leurs extrémités lors de leur
rét>lication (mécanisme également utilisé dans les
cancers). En pointillés, une structure alternative.
Source : Wikimedia http://
commons. wikimedia.org/
wiki/File: Pseudoknot.svg,
modifié par auteur (J. Nicolas)
................... ....
..
·· .. .
Hors-série n°52. L'informatique Tc:ingent:e
tex te e n ac ides aminés, la mac hine
s ' ap pe lle ribosome et le dé but du tex te
à trad uire co mme nce par auget pa rfo is
gug o u uug et finit in va ri abl e me nt pa r
11ag. 11ga o u uaa. Systé matique me nt ,
les triple ts de lettres d ' ARN vo nt
être transformés e n une le ttre d ' ac ide
aminé. On o bserve là des phé no mè nes
très di ffé re nts de ce qui se passe
e n c himie c lass ique : de vé ritabl es
codes sont inte rprétés de maniè re
rigoure use da ns la cellul e. Autre
exemple de mac hine e n ac ti o n sur
les ce llul es germin a les o u les ce llul es
cancéreuses, les télomérases. Il s ' ag it
d ' un assembl age de proté ines et
d ' ARN c hargé d ' ajo ute r un e séque nce
ré pétée spéc ifique à l'ex tré mité des
chro mosomes, po ur év ite r de pe rdre
des gènes lo rs de le ur ré plicati o n po ur
produire de no uve ll es ce llules.
Il reste e ncore de te lles machines à
découvrir au cœur des ce llules. Pa rmi
les découvertes réce ntes, évoquo ns
juste les structures de CRIS PR , au
no m improbable mai s do nt l' ex iste nce
est e ncore plu s surpre nante : o n
tro uve dans bo n no mbre de bactéri es
des séri es de mots courts ré pétés qui
fo rment une ossature dans laque ll e
vo nt s' inte rcale r d 'autres mo ts très
di ffé re nts, qui sembl e nt issus d ' une
lang ue étrangère à la bacté ri e. En
fa it , to ut comme no us, les bacté ri es
sont suje ttes à des attaques de virus
et cette structure se compo rte comme
un e nsemble de cases mé mo ires , q ui
reti e nne nt des mo rceaux de séque nces
de viru s re ncontrés et les reconnai ssent
lo rs de futures attaques: ce n' est ni plu s
ni mo in s qu ' un systè me immunita ire
auq ue l sont assoc iés un e nsemble de
mo ts et une mac hineri e spéc ifique de
gènes assoc iés.
De faço n c la ire et re marquable , les
mo ts a in si que le ur assembl age e t
le ur interpré tati o n par des machines
spéc ia li sées jo ue nt un rô le prédo mina nt
da ns les cellules vivantes. Au-de là des
phé no mè nes de the rmod yna mique,
d 'électrostatique
o u
autres
lo is
à caractè re continu , il ex iste des
re prése ntati o ns et des compo rte me nts
de nature sy mbo lique qui contrô le nt le
devenir des ce llul es.
langages, structures et interactions
Des mots qui s 'e nchaî ne nt de façon
contrô lée, y aurait- il do nc un langage,
vo ire des langages à l' œ uvre dans
les o rgani smes ? Précisons les te rmes
e mp loyés : il y a géné rale me nt de ux
niveaux d 'écriture dans une lang ue, le
Dans un ARN : télomérase.
Une structure de pseudo-nœud dans la partie ARN
de la télomérase humaine : cette structure permet de
positionner une matrice qui va générer des répétitions
TT ACCC à la fin des chromosomes et éviter le
raccourcissement de leurs extrémités lors de leur
rét>lication (mécanisme également utilisé dans les
cancers). En pointillés, une structure alternative.
Source : Wikimedia http://
commons. wikimedia.org/
wiki/File: Pseudoknot.svg,
modifié par auteur (J. Nicolas)
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Hors-série n°52. L'informatique Tc:ingent:e