Régime de production primaire dans le bassin algérien : interaction facteurs du milieu successions planctoniques
| Matériel et méthodes
2.3.3.2 Les équations simultanées inverses (ISE)
Cette méthode aborde le problème des marqueurs partagés en calculant la contribution de
chaque taxon à la Chl a totale à partir des concentrations de pigments marqueurs, tout en
soustrayant les contributions à ces pigments marqueurs par d'autres groupes (Bidigare et
Ondrusek, 1996 ; Everitt et al., 1990 ; Letelier et al., 1993 ; Vidussi et al., 2000).
Par exemple, Letelier et al. (1993) ont calculé la contribution des cyanobactéries à la Chl a de
la manière suivante :
[Chl a] cyano =2 ,1 {[Zea]−0,07([Chl b ]−2,5 [ Pras ])} … (6)
Cela supposait un rapport Chl a:Zea de 2,1 dans les cyanobactéries, mais il fallait corriger la
concentration de zéaxanthine pour les contributions des chlorophytes et des prasinophytes à
l'aide de la seconde moitié de l'équation. Des équations similaires sont nécessaires pour
chacun des principaux groupes d'algues qui partagent des pigments marqueurs communs.
Les différents rapports ont été modifiés par des méthodes inverses afin d'optimiser la Chl a
totale. Bien que cette approche soit mathématiquement solide, elle est très fastidieuse, car un
nouvel ensemble d'équations doit être développé pour chaque nouvelle population rencontrée.
2.3.3.3 Solveur Excel
Le module « Solveur » de Microsoft Excel fournit un outil simple pour optimiser les rapports
pigment:Chl a en construisant des équations simultanées, comme décrit précédemment.
Il a été utilisé en préliminaire aux calculs CHEMTAX (Not et al., 2008).
2.3.3.4 Le logiciel CHEMTAX (Mackey et al., 1996)
Il est similaire en principe à la méthode ISE dans le sens où les contributions des taxons
d'algues sont calculées à l'aide de rapports supposés « de meilleure qualité » qui sont ensuite
modifiés par le logiciel. Plutôt que de construire des ensembles d'équations, l'opérateur
construit une matrice de rapports pigment:Chl a pour chaque type d'algue prévu dans
l'ensemble d'échantillons, afin de calculer la teneur totale en Chl a de chaque échantillon.
CHEMTAX ajuste ensuite itérativement chacun de ces rapports pour minimiser la différence
entre les concentrations de Chl a observées et calculées dans l’ensemble des données.
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2.3.3.2 Les équations simultanées inverses (ISE)
Cette méthode aborde le problème des marqueurs partagés en calculant la contribution de
chaque taxon à la Chl a totale à partir des concentrations de pigments marqueurs, tout en
soustrayant les contributions à ces pigments marqueurs par d'autres groupes (Bidigare et
Ondrusek, 1996 ; Everitt et al., 1990 ; Letelier et al., 1993 ; Vidussi et al., 2000).
Par exemple, Letelier et al. (1993) ont calculé la contribution des cyanobactéries à la Chl a de
la manière suivante :
[Chl a] cyano =2 ,1 {[Zea]−0,07([Chl b ]−2,5 [ Pras ])} … (6)
Cela supposait un rapport Chl a:Zea de 2,1 dans les cyanobactéries, mais il fallait corriger la
concentration de zéaxanthine pour les contributions des chlorophytes et des prasinophytes à
l'aide de la seconde moitié de l'équation. Des équations similaires sont nécessaires pour
chacun des principaux groupes d'algues qui partagent des pigments marqueurs communs.
Les différents rapports ont été modifiés par des méthodes inverses afin d'optimiser la Chl a
totale. Bien que cette approche soit mathématiquement solide, elle est très fastidieuse, car un
nouvel ensemble d'équations doit être développé pour chaque nouvelle population rencontrée.
2.3.3.3 Solveur Excel
Le module « Solveur » de Microsoft Excel fournit un outil simple pour optimiser les rapports
pigment:Chl a en construisant des équations simultanées, comme décrit précédemment.
Il a été utilisé en préliminaire aux calculs CHEMTAX (Not et al., 2008).
2.3.3.4 Le logiciel CHEMTAX (Mackey et al., 1996)
Il est similaire en principe à la méthode ISE dans le sens où les contributions des taxons
d'algues sont calculées à l'aide de rapports supposés « de meilleure qualité » qui sont ensuite
modifiés par le logiciel. Plutôt que de construire des ensembles d'équations, l'opérateur
construit une matrice de rapports pigment:Chl a pour chaque type d'algue prévu dans
l'ensemble d'échantillons, afin de calculer la teneur totale en Chl a de chaque échantillon.
CHEMTAX ajuste ensuite itérativement chacun de ces rapports pour minimiser la différence
entre les concentrations de Chl a observées et calculées dans l’ensemble des données.
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