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Toxicologie nucléaire environnementale et humaine
Tableau 1 ■ Les contacts atomiques directs protéine-uranyle présents dans douze structures cristallines déposées à la Protein Data Bank.
PDB
Première sphère
de coordination
Deuxième sphère
de coordination
Remarques
1AUQ
2HIS
GLU
1B4Z
2 ASP
1 LYS
1 site simple
1 GLU
1 ASP, 2 LYS
1 site simple
ASP, GLU, acetates
LYS, ASP, HIS, ARG
2 clusters de
3 uranyles +/acétate en contact
cristallin
1BZO
1 GLU
1 ASP
(2 LYS, 1 ASP)
1 LYS, (1 LYS)
Contact cristallin
(Contact cristallin)
1CT9
3 ASP, 1 GLU, 1 SER,
AMP phosphate et ribose
TYR, LYS, ARG,
1 cluster de
4 uranyles dans
chaque sous unité.
1FE4
2 GLU, 1 ASP
1 LYS, 1ASP
Contact cristallin
1NCI
2 x (1ASP, 1 GLU)
(1 ASP, 1 ASN, 1 ARG)
Contact cristallin en
symétrie
1T9H
5 GLU, 1 ASP, 1 TYR,
2 LYS, 1 ARG, 2 HIS,
acetates et eau.
(6-HIS, ARG, ASN, GLN)
8 uranyle-3 acétate
en contact cristallin
avec l’étiquette
6-HIS avec
1 contact direct
entre HIS et un
atome d’uraniuirr^
2GIC
2 GLU, 1 ASP
1 ARG, 1 SER
3 sites dans chaque
sous unité —_———
-
1 ASP, 2 GLU, (1 ASP, 2
GLN)
Contact cristallin
-
2 ASP, 1 GLU, 1 LYS, 1
GLN
Contact cristallin
1EFQ
1 ASP, 1 TYR
Interactions
avec le squelette
40PGQPP4£_
1ANV
2 ASP, 1 GLU
1 ARG, 1 ASN, (1 LYS, 1
GLU)
Contact cristallin
1 GLU, 1 ASP
1 GLU, 1 GLN
Contact cristallin^
1 GLU, 1 ASP
1 GLU, 1 GLN
Même contact
cristallin avec
variation de
géométræ^^.
1 ASP
(2 GLU, 1 C-TER, 1 GLN)
Contactcristalhn^
2VEO
1 ASP, 1 GLU
1 ARG, 1 GLN
Site simpl£^
1 ASP, 1 GLU
^SitcjimP1^