Principaux micro-organismes recherchés en routine
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Cependant, beaucoup de bactéries peuvent se développer dans des milieux de
culture dont le pH peut se situer dans des limites assez larges. Des Escherichia
coli peuvent croître dans des bouillons nutritifs dont le pH peut être compris
entre 4,4 et 9, mais le pH optimum de croissance reste en général compris entre
6,5 et 7,5.
Au contraire, d’autres bactéries préfèrent des milieux très acides ou basiques :
-les germes acidophiles ont un pH optimum de croissance de 2. C’est le cas
de bactéries sulfo-oxydantes du cycle biologique du soufre telles que les Thiobacillus. Thiobacillus thiooxidans supporte un pH de 0 et peut vivre en milieu
sulfurique ;
- les germes basophiles ont un pH optimum de 9. C’est l’exemple typique des
Vibrio (V. cholerae, V. parahaemolyticus...), qui sont également des bactéries
halophiles ou halotolérantes suivant les espèces (cf. annexe générale 1 « Lexique
de microbiologie » ; Delarras et Trébaol, 2003).
2.3.
Pression osmotique
Les bactéries sont en général insensibles à la pression osmotique sauf exceptions. On peut donc définir les groupes suivants :
2.3.1. Bactéries non-halophiles
Les bactéries non halophiles (entérobactéries, Pseudomonas...) se développent dans des milieux de culture contenant une concentration de NaCl inférieure
à 0,2 M.
2.3.2. Bactéries halophiles
Les bactéries halophiles (entérobactéries, Pseudomonas...) se développent
dans des milieux de culture contenant une concentration de NaCl supérieure à
0,2 M.
2.3.2.1. Bactéries sténohalines
► Halophiles faibles
?
Les bactéries halophiles faibles se développent dans des milieux de culture
= contenant une concentration de NaCl compris entre 0,2 et 0,5 M.
|
Ce sont les bactéries marines typiques telles que Deleya marina (ex-Pseudo| monas marina), Flavobacterium (suivant les espèces), Vibrio parahaemolyticus
। (espèce recherchée dans les coquillages bivalves, Delarras et Trébaol, 2003)...
| ► Halophiles modérées
î
Les bactéries halophiles modérées se développent dans des milieux de culture
5 contenant une concentration de NaCl compris entre 0,8 et 3,3 M.
|
Ce sont des bactéries vivant en milieu marin ou dans un autre biotope salé
o telles que Salinivibrio costicola ex-Vibrio costicola, Vibrio alginolyticus, espèce
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Cependant, beaucoup de bactéries peuvent se développer dans des milieux de
culture dont le pH peut se situer dans des limites assez larges. Des Escherichia
coli peuvent croître dans des bouillons nutritifs dont le pH peut être compris
entre 4,4 et 9, mais le pH optimum de croissance reste en général compris entre
6,5 et 7,5.
Au contraire, d’autres bactéries préfèrent des milieux très acides ou basiques :
-les germes acidophiles ont un pH optimum de croissance de 2. C’est le cas
de bactéries sulfo-oxydantes du cycle biologique du soufre telles que les Thiobacillus. Thiobacillus thiooxidans supporte un pH de 0 et peut vivre en milieu
sulfurique ;
- les germes basophiles ont un pH optimum de 9. C’est l’exemple typique des
Vibrio (V. cholerae, V. parahaemolyticus...), qui sont également des bactéries
halophiles ou halotolérantes suivant les espèces (cf. annexe générale 1 « Lexique
de microbiologie » ; Delarras et Trébaol, 2003).
2.3.
Pression osmotique
Les bactéries sont en général insensibles à la pression osmotique sauf exceptions. On peut donc définir les groupes suivants :
2.3.1. Bactéries non-halophiles
Les bactéries non halophiles (entérobactéries, Pseudomonas...) se développent dans des milieux de culture contenant une concentration de NaCl inférieure
à 0,2 M.
2.3.2. Bactéries halophiles
Les bactéries halophiles (entérobactéries, Pseudomonas...) se développent
dans des milieux de culture contenant une concentration de NaCl supérieure à
0,2 M.
2.3.2.1. Bactéries sténohalines
► Halophiles faibles
?
Les bactéries halophiles faibles se développent dans des milieux de culture
= contenant une concentration de NaCl compris entre 0,2 et 0,5 M.
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Ce sont les bactéries marines typiques telles que Deleya marina (ex-Pseudo| monas marina), Flavobacterium (suivant les espèces), Vibrio parahaemolyticus
। (espèce recherchée dans les coquillages bivalves, Delarras et Trébaol, 2003)...
| ► Halophiles modérées
î
Les bactéries halophiles modérées se développent dans des milieux de culture
5 contenant une concentration de NaCl compris entre 0,8 et 3,3 M.
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Ce sont des bactéries vivant en milieu marin ou dans un autre biotope salé
o telles que Salinivibrio costicola ex-Vibrio costicola, Vibrio alginolyticus, espèce