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devient fluorescent avec une couleur rouge-orangée, 20 fois plus intense lorsqu'il est lié à
l'ADN.
A
B
Figure3.2. Observation d’un gel d’électrophorèse. A. sous UV B. photo du gel
Alternativement, le gel peut être incubé dans un bain contenant du SYBR Green I (pour les
acides nucléiques doubles brins) ou du SYBR Green II (pour détecter aussi les acides
nucléiques simples brins). Le SYBR Green présente l'avantage d'une moindre toxicité et d'une
sensibilité plus élevée permettant de détecter des quantités plus faibles d'acides nucléiques.
Dans certains cas, les molécules séparées sont marquées radioactivement, ce qui permet leur
détection par autoradiographie
3.3.2. Autres techniques de séparation des acides nucléiques
 Chromatographie des acides nucléiques
Les mêmes techniques de chromatographies utilisées pour purifier les protéines sont aussi
applicables pour la purification des acides nucléiques
- chromatographie par échange d’ions: puisque l’ADN et l’ARN sont de charge négative,
un échangeur anionique sera utilisé. Méthode utilisée pour purifier des oligonucléotides.
- filtration sur gel: surtout utilisée les oligonucléotides (de 10 à 100 nucléotides)
- chromatographie d’affinité: utilisée pour purifier les ARNm des cellules eucaryotes. Ces
ARN possèdent une queue de poly(A) à leur extrêmité 3’en utilisant des polyT ou polyU.
 Ultracentrifugation et purification de l’ADN
Une méthode couramment utilisée pour purifier et séparer l’ADN est l’ultracentrifugation sur
gradient de chlorure de césium