12 - La conservation de la qualité des milieux littoraux
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entre les effectifs des principales composantes de la flore microbiologique. Aussi, a-t-on
été amené à évaluer la qualité bactérienne des eaux par numération des germes
d'origine fécale, mais non dangereux pour l'homme, présents en grande quantité dans
les rejets urbains. Il existe, par ailleurs, des relations entre la qualité bactérienne des
eaux et celle des coquillages. Par exemple, Plusquellec et al. (1986) ont publié, pour la
moule, des équations de corrélation relatives aux coliformes et aux streptocoques
fécaux.
Toutefois, ces équations d'équilibre ne rendent pas compte des phénomènes à
court terme qui interviennent lors d'un cycle de marée ou d'une série de pluies. Par
exemple, au moment de la pleine mer, alors que les eaux sont peu ou pas contaminées,
les concentrations en germes restent élevées si les eaux sont insalubres en périodes de
basse mer. Ce phénomène est bien connu des stations de purification des coquillages,
pour lesquelles on estime à 48 heures le temps minimum nécessaire à la
décontamination.
3.4.1.1. Caractérisalion du risque pathologique
Parmi les très nombreux germes microbiens naturellement présents dans les eaux
littorales (germes halophiles), très peu se révèlent pathogènes pour l'homme. Ainsi,
Vibrio parahaemolyticus est le seul germe marin parfois identifié comme étant à
l'origine de toxi-infections alimentaires humaines. La qualité microbiologique du milieu
marin, en regard de l'usage alimentaire des produits, est donc étroitement el
essentiellement dépendante des apports continentaux.
La charge microbienne dépend de l'origine des contaminations. La plupart des
germes potentiellement pathogènes pour l'homme proviennent des vertébrés
supérieurs, de l'homme notamment : ils sont communément associés à la flore
intestinale habituelle de ces vertébrés. Leur capacité de survie dans l'eau de mer varie
selon les espèces et les souches considérées et, pour une même espèce, les conditions
ambiantes rencontrées (température, salinité, charge en matières organiques,
turbidité, ...). Le matériel organique semble intervenir comme facteur favorisant. Cette
association avec le matériel particulaire explique les phénomènes de piégeage des
microorganismes dans les sédiments et de recontamination de la colonne d'eau lors de
remises en suspension des sédiments sous-jacents.
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