microscopie électronique que des cristaux d’aragonite sont formés autour de cellules
bactériennes mortes. Cornée (1983) observe des formes cristallines analogues dans des
dépôts de marais salants et des cultures microbiennes, mais le rôle des micro-organismes
dans ces cristallisations ne peut être précisé. Berner (1969) pense que la formation de
carbonate de calcium, est liée à la décomposition des poissons, source de Triméthyl
ammonium n-oxyde (TMAO) qui peut être utilisé comme accepteur terminal d’électrons
par certaines bactéries.
Pour déterminer si les bactéries ont un rôle actif ou passif dans la précipitation du
carbonate, nous avons provoqué sur des échantillons d’eau et de sédiment d’un environnement lagunaire, différents stress destinés à induire des pertubations sur la structure des
microflores. Au moyen de techniques bactériologiques, nous avons suivi la dynamique de
ces communautés bactériennes, en particulier les effets sur la fraction de chaque peuplement capable de précipiter le carbonate. L’importance de la collection de souches bactériennes obtenues en culture pure, nous a permis, après avoir cherché leur capacité de
précipiter le carbonate, d’ammonifier les acides aminés, et de réduire le nitrate, parmi de
nombreux autres tests (105), de mettre en évidence les conditions idéales de prolifération
de ce groupe bactérien. De plus, la recherche d’une corrélation ou d’une anti-corrélation
par le moyen de l’analyse factorielle des correspondances, permet de préciser la dépendance de la calcification avec l’ammonification. La même recherche concernant la réduction des nitrates et celle du sulfate fera l’objet de travaux ultérieurs.
MATERIELS ET METHODES
Prélèvements
Les prélèvements ont été effectués dans l’herbier à Posidonia oceanica de la lagune du
Brusc (Méditerranée occidentale). Neuf carottes ont été prélevées simultanément dans cet
herbier au moyen de tube en plexiglass de 5 cm de diamètre et de 30 cm de longueur. Pour
chacune des 9 carottes, nous avons étudié l’eau surnageante et trois niveaux du sédiment
sablo-vaseux : la zone oxydée comprise entre 0 et 3 cm, la zone comprise entre 8 et 10 cm et
la zone comprise entre 18 et 20 cm, qui correspondent à des zones réduites. Les analyses
bactériologiques ont été effectuées sur 44 échantillons et 880 souches au total ont été
isolées au moyen d’une grille d’échantillonnage aléatoire sélectionnant 20 souches par
échantillon.
Montage expérimental
La première carotte a été étudiée immédiatement après sa collecte. Elle constitue le point
de référence, traduisant l’état des communautés bactériennes et de la réserve minérale
dans les conditions naturelles de la lagune du Brusc au moment de son prélèvement
(septembre 1982). Les autres carottes ont été conservées au laboratoire dans leur tube de
prélèvement en PVC de 5 cm diamètre, de 30 cm de longueur, dans différentes conditions
destinées à induire différentes pertubations de la structure des communautés bactériennes
(fig. 1).
La carotte n° 1 et l’eau surnageante correspondante (E1 ), analysées immédiatement après
le prélèvement, ont été utilisées pour dénombrer les peuplements bactériens et définir leur
structure taxonomique.
La carotte n°2 et son eau surnageante (E2), ont été incubées en anaérobiose pendant un
mois, à l’obscurité, à température ambiante, après adjonction de TMAO à raison de 2,22
g/l de sédiment et d’acétate de calcium (2,5 g/l). Cet écosystème clos n°2, montre
l’influence de l’anaérobiose sur la prolifération des bactéries calcifiantes. Le TMAO
ajouté sert d’accepteur terminal d’électrons organique (Sakaguchi et Akai, 1977). L’enri148
bactériennes mortes. Cornée (1983) observe des formes cristallines analogues dans des
dépôts de marais salants et des cultures microbiennes, mais le rôle des micro-organismes
dans ces cristallisations ne peut être précisé. Berner (1969) pense que la formation de
carbonate de calcium, est liée à la décomposition des poissons, source de Triméthyl
ammonium n-oxyde (TMAO) qui peut être utilisé comme accepteur terminal d’électrons
par certaines bactéries.
Pour déterminer si les bactéries ont un rôle actif ou passif dans la précipitation du
carbonate, nous avons provoqué sur des échantillons d’eau et de sédiment d’un environnement lagunaire, différents stress destinés à induire des pertubations sur la structure des
microflores. Au moyen de techniques bactériologiques, nous avons suivi la dynamique de
ces communautés bactériennes, en particulier les effets sur la fraction de chaque peuplement capable de précipiter le carbonate. L’importance de la collection de souches bactériennes obtenues en culture pure, nous a permis, après avoir cherché leur capacité de
précipiter le carbonate, d’ammonifier les acides aminés, et de réduire le nitrate, parmi de
nombreux autres tests (105), de mettre en évidence les conditions idéales de prolifération
de ce groupe bactérien. De plus, la recherche d’une corrélation ou d’une anti-corrélation
par le moyen de l’analyse factorielle des correspondances, permet de préciser la dépendance de la calcification avec l’ammonification. La même recherche concernant la réduction des nitrates et celle du sulfate fera l’objet de travaux ultérieurs.
MATERIELS ET METHODES
Prélèvements
Les prélèvements ont été effectués dans l’herbier à Posidonia oceanica de la lagune du
Brusc (Méditerranée occidentale). Neuf carottes ont été prélevées simultanément dans cet
herbier au moyen de tube en plexiglass de 5 cm de diamètre et de 30 cm de longueur. Pour
chacune des 9 carottes, nous avons étudié l’eau surnageante et trois niveaux du sédiment
sablo-vaseux : la zone oxydée comprise entre 0 et 3 cm, la zone comprise entre 8 et 10 cm et
la zone comprise entre 18 et 20 cm, qui correspondent à des zones réduites. Les analyses
bactériologiques ont été effectuées sur 44 échantillons et 880 souches au total ont été
isolées au moyen d’une grille d’échantillonnage aléatoire sélectionnant 20 souches par
échantillon.
Montage expérimental
La première carotte a été étudiée immédiatement après sa collecte. Elle constitue le point
de référence, traduisant l’état des communautés bactériennes et de la réserve minérale
dans les conditions naturelles de la lagune du Brusc au moment de son prélèvement
(septembre 1982). Les autres carottes ont été conservées au laboratoire dans leur tube de
prélèvement en PVC de 5 cm diamètre, de 30 cm de longueur, dans différentes conditions
destinées à induire différentes pertubations de la structure des communautés bactériennes
(fig. 1).
La carotte n° 1 et l’eau surnageante correspondante (E1 ), analysées immédiatement après
le prélèvement, ont été utilisées pour dénombrer les peuplements bactériens et définir leur
structure taxonomique.
La carotte n°2 et son eau surnageante (E2), ont été incubées en anaérobiose pendant un
mois, à l’obscurité, à température ambiante, après adjonction de TMAO à raison de 2,22
g/l de sédiment et d’acétate de calcium (2,5 g/l). Cet écosystème clos n°2, montre
l’influence de l’anaérobiose sur la prolifération des bactéries calcifiantes. Le TMAO
ajouté sert d’accepteur terminal d’électrons organique (Sakaguchi et Akai, 1977). L’enri148