Marine lipids
Effets in vitro de divers hydrocarbures,
source de carbone, sur la composition
lipidique de bactéries hydrocarbonoclastes
marines
P. Doumenq
(l) , J. Artaud
(1) , E. Aries
(1) , M. Acquaviva
(2) ,
J.-P. Durbec
(2) , G. Mille
(1) J.-C. Bertrand
(2)
(1) Université d’Aix-Marseille, faculté des sciences et techniques de Saint-Jérôme,
laboratoire de chimie analytique de l'environnement, EP CNRS, case 312,
13397 Marseille Cedex 20, France
(2) Université de la Méditerranée, faculté des sciences de Luminy,
centre d'océanologie de Marseille, UMR 6535, case 901, 13288 Marseille Cedex 9, France
Dans lc milieu marin, pour évaluer l’effet d'un apport chronique ou accidentel de polluants sur le compartiment bactérien sédimentaire, il est
mdispensable d’être en mesure d evaluer la biomasse et la structure des
communautés. À côté des techniques classiquement utilisées qui présentent un certain nombre de limites, il a été proposé plus récemment,
pour décrire ces deux paramètres, de faire appel à l’analyse de marqueurs biochimiques et, plus précisément, des lipides constitutifs des
membranes cytoplasmiques et des parois bactériennes. Ces lipides et
les acides gras phospholipidiques qui leur sont associés sont en effet des
composés essentiels, possédant une très grande diversité structurale.
Le niveau de spécificité des acides gras utilisés comme marqueurs biochimiques est variable. Ils peuvent être représentatifs des bactéries lato
sensu, spécifiques d’un groupe de bactéries (bactéries sulfatoréductrices,
méthanogènes), d'un genre ou même d’une espèce. Ils peuvent également être les révélateurs (études in vitro) de différences de conditions
environnementales (aérobiose-anaérobiose, température, diversité des
sources de carbone, salinité) ainsi que de la présence de composés xénobiotiques.
Le but de ce travail est, d’une part, d’approfondir les connaissances au
plan fondamental des marqueurs lipidiques procaryotiques afin d’obtenir des descriptions plus fiables des différentes communautés présentes au sein des sédiments marins et, d’autre part, d’évaluer l’effet des
hydrocarbures pétroliers sur ces communautés en étudiant l’évolution
de ces marqueurs.
Dans un premier temps, afin de tester l’importance relative de différentes
conditions environnementales, les effets de différents paramètres de cultures (température, source de carbone, phase de croissance, oxygénation) ont été envisagés pour P. nautica, bactérie marine dénitrifiante
98
Effets in vitro de divers hydrocarbures,
source de carbone, sur la composition
lipidique de bactéries hydrocarbonoclastes
marines
P. Doumenq
(l) , J. Artaud
(1) , E. Aries
(1) , M. Acquaviva
(2) ,
J.-P. Durbec
(2) , G. Mille
(1) J.-C. Bertrand
(2)
(1) Université d’Aix-Marseille, faculté des sciences et techniques de Saint-Jérôme,
laboratoire de chimie analytique de l'environnement, EP CNRS, case 312,
13397 Marseille Cedex 20, France
(2) Université de la Méditerranée, faculté des sciences de Luminy,
centre d'océanologie de Marseille, UMR 6535, case 901, 13288 Marseille Cedex 9, France
Dans lc milieu marin, pour évaluer l’effet d'un apport chronique ou accidentel de polluants sur le compartiment bactérien sédimentaire, il est
mdispensable d’être en mesure d evaluer la biomasse et la structure des
communautés. À côté des techniques classiquement utilisées qui présentent un certain nombre de limites, il a été proposé plus récemment,
pour décrire ces deux paramètres, de faire appel à l’analyse de marqueurs biochimiques et, plus précisément, des lipides constitutifs des
membranes cytoplasmiques et des parois bactériennes. Ces lipides et
les acides gras phospholipidiques qui leur sont associés sont en effet des
composés essentiels, possédant une très grande diversité structurale.
Le niveau de spécificité des acides gras utilisés comme marqueurs biochimiques est variable. Ils peuvent être représentatifs des bactéries lato
sensu, spécifiques d’un groupe de bactéries (bactéries sulfatoréductrices,
méthanogènes), d'un genre ou même d’une espèce. Ils peuvent également être les révélateurs (études in vitro) de différences de conditions
environnementales (aérobiose-anaérobiose, température, diversité des
sources de carbone, salinité) ainsi que de la présence de composés xénobiotiques.
Le but de ce travail est, d’une part, d’approfondir les connaissances au
plan fondamental des marqueurs lipidiques procaryotiques afin d’obtenir des descriptions plus fiables des différentes communautés présentes au sein des sédiments marins et, d’autre part, d’évaluer l’effet des
hydrocarbures pétroliers sur ces communautés en étudiant l’évolution
de ces marqueurs.
Dans un premier temps, afin de tester l’importance relative de différentes
conditions environnementales, les effets de différents paramètres de cultures (température, source de carbone, phase de croissance, oxygénation) ont été envisagés pour P. nautica, bactérie marine dénitrifiante
98