Pollutions diffuses : du bassin versant au littoral
atmosphère microaérophile, puis isolement sur géloses de Karmali et
de Skirrow. La confirmation des colonies suspectes se fait par identification par hybridation avec une sonde Accuprobe™ Campylobacter.
- E. coli VTEC, sécréteur de vérotoxines, a été recherché par amplification génique (PCR) après une phase d'enrichissement en bouillon
« modified EC » additionné de novobiocine. L’amplification utilise des
amorces reconnaissant les gènes vts. La révélation se fait par hybridation en milieu liquide.
- Yersinia enterocolitica a été recherchée par nested-PCR directe, à l'aide
d’amorces reconnaissant le gène ail.
Résultats et discussion
Six campagnes de prélèvement ont eu lieu (tab. 1).
Tableau 1 - Caractéristiques des campagnes.
Campagnes
Pluviométrie cumulée sur : 12 nov. 96
2 4 tèv. 97
26 mai 97
1 7 nov. 97
1 2 janv. 98
19 oct. 98
2 jours précédents
6,2
0,8
0,0
0,0
0,0
4.4
5 jours précédents
III,0
1.0
0.0
3,8
5,8
7, 4
10 jours précédents
22.2
19,6
1 5,0
23,2
47,6
29, 4
Autorisation épandages
oui
oui
oui
oui
non
oui
Il s est avéré difficile d’étudier des situations caractéristiques de crue
et de sécheresse, comme cela était prévu initialement, compte tenu des
contraintes analytiques, des coefficients de marée, etc. Les campagnes
se sont déroulées en période plutôt sèches et de faibles pluies, ne permettant d’appréhender que partiellement le rôle du ruissellement sur
la contamination des rivières et des coquillages. Néanmoins, ces conditions sont représentatives du climat moyen de cette région qui bénéficie d’un ensoleillement important et de précipitations moyennes annuelles
de 654 mm, parmi les plus faibles enregistrées en Bretagne. La campagne
du 1 7 novembre 1997 a été classée en période d epandage car se situant
deux jours seulement après la date limite d’autorisation.
Concentrations bactériennes dans les rivières
D’une façon générale, les concentrations en bactéries pathogènes relevées dans les rivières du bassin versant de la baie de la Fresnaye sont
moyennes puisque :
- 10,2 % des échantillons présentaient une concentration supérieure ou
égale à 100/100 ml d’une ou plusieurs bactéries pathogènes ;
- 15,7 % une concentration de 10 à 100/100 ml;
- 12 % une concentration de 1 à 10/100 ml;
- 62 % une concentration inférieure à 1/100 ml.
Toutes les rivières sont concernées par la présence de bactéries pathogènes. Chaque bactérie recherchée a été isolée au moins une fois dans
chaque rivière, a l' exception de Y. enterocolitica qui n’a pas été trouvée
174
atmosphère microaérophile, puis isolement sur géloses de Karmali et
de Skirrow. La confirmation des colonies suspectes se fait par identification par hybridation avec une sonde Accuprobe™ Campylobacter.
- E. coli VTEC, sécréteur de vérotoxines, a été recherché par amplification génique (PCR) après une phase d'enrichissement en bouillon
« modified EC » additionné de novobiocine. L’amplification utilise des
amorces reconnaissant les gènes vts. La révélation se fait par hybridation en milieu liquide.
- Yersinia enterocolitica a été recherchée par nested-PCR directe, à l'aide
d’amorces reconnaissant le gène ail.
Résultats et discussion
Six campagnes de prélèvement ont eu lieu (tab. 1).
Tableau 1 - Caractéristiques des campagnes.
Campagnes
Pluviométrie cumulée sur : 12 nov. 96
2 4 tèv. 97
26 mai 97
1 7 nov. 97
1 2 janv. 98
19 oct. 98
2 jours précédents
6,2
0,8
0,0
0,0
0,0
4.4
5 jours précédents
III,0
1.0
0.0
3,8
5,8
7, 4
10 jours précédents
22.2
19,6
1 5,0
23,2
47,6
29, 4
Autorisation épandages
oui
oui
oui
oui
non
oui
Il s est avéré difficile d’étudier des situations caractéristiques de crue
et de sécheresse, comme cela était prévu initialement, compte tenu des
contraintes analytiques, des coefficients de marée, etc. Les campagnes
se sont déroulées en période plutôt sèches et de faibles pluies, ne permettant d’appréhender que partiellement le rôle du ruissellement sur
la contamination des rivières et des coquillages. Néanmoins, ces conditions sont représentatives du climat moyen de cette région qui bénéficie d’un ensoleillement important et de précipitations moyennes annuelles
de 654 mm, parmi les plus faibles enregistrées en Bretagne. La campagne
du 1 7 novembre 1997 a été classée en période d epandage car se situant
deux jours seulement après la date limite d’autorisation.
Concentrations bactériennes dans les rivières
D’une façon générale, les concentrations en bactéries pathogènes relevées dans les rivières du bassin versant de la baie de la Fresnaye sont
moyennes puisque :
- 10,2 % des échantillons présentaient une concentration supérieure ou
égale à 100/100 ml d’une ou plusieurs bactéries pathogènes ;
- 15,7 % une concentration de 10 à 100/100 ml;
- 12 % une concentration de 1 à 10/100 ml;
- 62 % une concentration inférieure à 1/100 ml.
Toutes les rivières sont concernées par la présence de bactéries pathogènes. Chaque bactérie recherchée a été isolée au moins une fois dans
chaque rivière, a l' exception de Y. enterocolitica qui n’a pas été trouvée
174