Chapitre II
Matériel et méthodes
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Où 𝑣̇ est la conductance énergétique, un paramètre qui indique plus ou moins la vitesse à
laquelle l'énergie peut être mobilisée dans les réserves, et enfin [𝐸 𝐺 ] donne les coûts de
croissance spécifiques au volume. Les paramètres 𝑣̇ et [𝐸 𝐺 ] sont également des paramètres
primaires. Ces paramètres primaires se retrouvent également dans de nombreuses autres
relations, par exemple la relation entre la respiration et la masse corporelle contient également
les paramètres : {𝑃 ̇
𝐴𝑚 }, κ, [𝑃 ̇
𝑀 ], 𝑣̇ et [𝐸 𝐺 ]. En étudiant le taux de respiration des œufs de saumon,
Smith (1957) a déjà observé en 1957 que la respiration est proportionnelle à une somme
pondérée du volume et du taux de croissance en volume, et cette relation est confirmée par la
théorie DEB. La théorie DEB offre donc la possibilité de prédire les taux de croissance en
réponse aux aliments et à la température, même si la croissance n'a jamais été mesurée, mais
seulement si suffisamment d'autres types de données, dont certains doivent être des taux, sont
des paramètres disponibles. Nous utilisons cette possibilité pour prédire la croissance et l'âge à
maturité des espèces étudiées, en utilisant une variété d'autres informations disponibles dans la
littérature.
Les routines du modèle DEB et la routine d'estimation des paramètres font partie des logiciels
DEBtool et Add-my-pet et peuvent être téléchargées à partir du site Theoretical Biology de la
VU University Amsterdam http://www.bio.vu.nl/thb/deb/deblab/debtool
Tableau II. 3. Description des données d’entrée du modèle DEB standard
Type de données
Symbole Description
Données à variation
nulle
𝑎 𝑏
Age à la naissance
𝑎 𝑠
Age à la première maturité sexuelle
𝑎 𝑚
Longévité
𝐿 𝑏
Longueur à la naissance
𝐿 𝑝
Longueur de la première maturité sexuelle
𝐿 𝑖
Longueur maximale
𝑊 𝑤
𝑏
Poids à la naissance
𝑊 𝑤
𝑝
Poids à la puberté
𝑊 𝑤
𝑖
Poids maximal
𝑅 𝑖
Reproduction maximale
Pseudo données
(paramètres généralisés
de l’animal)
𝑣̇
Conductance énergétique
κ
Fraction d’allocation au maintien somatique
κ 𝑅
Efficacité de la reproduction
[𝑝̇ 𝑀]
Volume spécifique à la maintenance somatique
κ 𝐽
Coefficient de taux de maintien de la maturité
κ 𝐺
Efficacité de la croissance
Données univariées
(t, Lt)
Clé âge-longueur
(LT, PT)
Relation taille-poids