Première partie : Synthèse bibliographique
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3. Microbiologie des poissons :
Normalement, la chair du poisson est stérile. Les régions contaminées sont le mucus
qui recouvre la peau, les branchies et le tube digestif (JOFFIN et JOFFIN 2010).
La contamination bactérienne de la chair ne survient qu’après la capture. Les sources
de cette contamination sont diverses et peuvent être réparties en deux groupes (ABOTCHI et
SEYDI, 2010).
la contamination endogène,
la contamination exogène.
3.1 Contamination endogène ou primaire :
Cette contamination a lieu du vivant de l’animal. Elle se fait via la respiration,
l’alimentation et lors des déplacements. La composition et la quantité de cette flore
bactérienne dépend de l’origine, de la température de l’eau, de l’alimentation etc.
(DELARRAS, 2007).
Certains travaux ont montré une prédominance des bactéries à Gram-négatif
dans la flore initiale de poissons issus des eaux tempérées (GRAM et DALGAARD,
2002) alors qu’une proportion élevée de coques à Gram-positif et de Bacillus sp est
trouvée dans certains poissons provenant des mers chaudes et des eaux tropicales.
Les bactéries d’origine endogène peuvent être subdivisées en 3 classes :
Germes typiquement aquatiques :
Ils appartiennent généralement aux genres Pseudomonas, Vibrio,
Flavobacterium, Halobacterium, Micrococcus, Corynebacterium, Photobacterium,
(GUIRAUD, 2003).
Germes d’origine tellurique :
Ce sont des bactéries sporulées en particulier les genres Clostridium et
Bacillus. Leur dissémination dans les milieux aquatiques est assurée par les eaux de
ruissellement et les eaux de pluie (GUIRAUD, 2003, ABOTCHI et SEYDI, 2010).
Germes de contamination d’origine humaine et/ou animale :
Ces germes proviennent du tube digestif de l’homme et des animaux. Ils se
retrouvent dans les milieux aquatiques à la faveur d’une pollution par les eaux usées
mal ou non traitées (Salmonella, Shigella, Staphylococcus, etc), (GUIRAUD, 2003).
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3. Microbiologie des poissons :
Normalement, la chair du poisson est stérile. Les régions contaminées sont le mucus
qui recouvre la peau, les branchies et le tube digestif (JOFFIN et JOFFIN 2010).
La contamination bactérienne de la chair ne survient qu’après la capture. Les sources
de cette contamination sont diverses et peuvent être réparties en deux groupes (ABOTCHI et
SEYDI, 2010).
la contamination endogène,
la contamination exogène.
3.1 Contamination endogène ou primaire :
Cette contamination a lieu du vivant de l’animal. Elle se fait via la respiration,
l’alimentation et lors des déplacements. La composition et la quantité de cette flore
bactérienne dépend de l’origine, de la température de l’eau, de l’alimentation etc.
(DELARRAS, 2007).
Certains travaux ont montré une prédominance des bactéries à Gram-négatif
dans la flore initiale de poissons issus des eaux tempérées (GRAM et DALGAARD,
2002) alors qu’une proportion élevée de coques à Gram-positif et de Bacillus sp est
trouvée dans certains poissons provenant des mers chaudes et des eaux tropicales.
Les bactéries d’origine endogène peuvent être subdivisées en 3 classes :
Germes typiquement aquatiques :
Ils appartiennent généralement aux genres Pseudomonas, Vibrio,
Flavobacterium, Halobacterium, Micrococcus, Corynebacterium, Photobacterium,
(GUIRAUD, 2003).
Germes d’origine tellurique :
Ce sont des bactéries sporulées en particulier les genres Clostridium et
Bacillus. Leur dissémination dans les milieux aquatiques est assurée par les eaux de
ruissellement et les eaux de pluie (GUIRAUD, 2003, ABOTCHI et SEYDI, 2010).
Germes de contamination d’origine humaine et/ou animale :
Ces germes proviennent du tube digestif de l’homme et des animaux. Ils se
retrouvent dans les milieux aquatiques à la faveur d’une pollution par les eaux usées
mal ou non traitées (Salmonella, Shigella, Staphylococcus, etc), (GUIRAUD, 2003).