Chapitre Premier : Généralités et Méthodes d’étude
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Distinction taxonomique moyenne ∆ + (WARWICK et CLARKE, 1998)
Cet indice mesure l’éloignement taxonomique moyen entre deux espèces différentes tirées au
hasard dans un échantillon.
En utilisant des données de présence/absence, ∆ et ∆* se simplifient par ∆
+ . Dans ce cas, on peut
considérer les abondances comme une unité de présence (CLARKE et WARWICK, 1998).
∆
+ est calculé à partir de la formule 20 :
∆
+
= 2
∑ ∑ ω ij
i
í µí±í µí±(í µí±í µí±−1)
Avec : ωij : la distance à parcourir entre l’espèce i et le premier nœud commun avec l’espèce j
dans la classification hiérarchique.
S : le nombre d’espèces
La double somme s’effectue sur toutes les paires d’espèces i et j.
Cette distance (ωij) qui sépare deux espèces i et j au nœud commun dans l’arbre taxonomique
peut être calculée par deux méthode : soit par incrémentation de 1 à chaque niveau taxonomique,
soit par la standardisation de manière à ce que la valeur soit égale à 100 pour deux espèces
reliées au niveau taxonomique le plus haut considéré dans l’étude (Fig.I.5).
Figure I.5 calcul des deux types de distances taxonomiques au nœud commun entre deux
individus ou espèces ; ω1 la méthode d’incrémentation de 1, ω100 la méthode d’incrémentation
bornée entre 0 et 100
Afin de comparer les échantillons entre eux à partir de ces indices, une conversion des valeurs
doit être faite pour faciliter et préciser l’interprétation de la différence entre échantillons d’un
point de vue écologique.
Pour convertir une valeur de ∆a obtenue par la méthode de l’incrémentation bornée entre 0 et 100
à une valeur d’un indice ∆b basé sur l’incrémentation de 1, on réalise l’opération suivante :
∆ b =
∆ a
100/(nombre de niveaux taxonomiques considérés−1)
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Distinction taxonomique moyenne ∆ + (WARWICK et CLARKE, 1998)
Cet indice mesure l’éloignement taxonomique moyen entre deux espèces différentes tirées au
hasard dans un échantillon.
En utilisant des données de présence/absence, ∆ et ∆* se simplifient par ∆
+ . Dans ce cas, on peut
considérer les abondances comme une unité de présence (CLARKE et WARWICK, 1998).
∆
+ est calculé à partir de la formule 20 :
∆
+
= 2
∑ ∑ ω ij
i
Avec : ωij : la distance à parcourir entre l’espèce i et le premier nœud commun avec l’espèce j
dans la classification hiérarchique.
S : le nombre d’espèces
La double somme s’effectue sur toutes les paires d’espèces i et j.
Cette distance (ωij) qui sépare deux espèces i et j au nœud commun dans l’arbre taxonomique
peut être calculée par deux méthode : soit par incrémentation de 1 à chaque niveau taxonomique,
soit par la standardisation de manière à ce que la valeur soit égale à 100 pour deux espèces
reliées au niveau taxonomique le plus haut considéré dans l’étude (Fig.I.5).
Figure I.5 calcul des deux types de distances taxonomiques au nœud commun entre deux
individus ou espèces ; ω1 la méthode d’incrémentation de 1, ω100 la méthode d’incrémentation
bornée entre 0 et 100
Afin de comparer les échantillons entre eux à partir de ces indices, une conversion des valeurs
doit être faite pour faciliter et préciser l’interprétation de la différence entre échantillons d’un
point de vue écologique.
Pour convertir une valeur de ∆a obtenue par la méthode de l’incrémentation bornée entre 0 et 100
à une valeur d’un indice ∆b basé sur l’incrémentation de 1, on réalise l’opération suivante :
∆ b =
∆ a
100/(nombre de niveaux taxonomiques considérés−1)
