Chapitre II
Matériel et méthodes
16
2.2. Définition des paramètres DEB
En utilisant plusieurs ensembles de données de l'histoire de vie d’un individu (paramètre de
croissance, de reproduction), quelques paramètres du modèle DEB sont estimé selon une
procédure décrite par Lika et al. (2011). Les paramètres DEB restants ont été définis sur des
valeurs prédéfinies tirées de Kooijman (2010). Le tableau II.2 regroupe l’appellation et
désignation des paramètres que nous allons estimer dans notre étude.
Tableau II. 2. Définition des paramètres du modèle DEB standard (Meer et al., 2014).
Paramètre Unité
Désignation
𝑇 𝐴
K
Température d'Arrhenius
𝑓
_
Réponse fonctionnelle échelonnée
𝑧
_
Facteur de zoom
𝛿 𝑀
_
Paramètre de forme
𝑣̇
cm d
-1
Conductance énergétique
𝜅
_
Fraction d'allocation en soma
𝜅 𝑋
_
Efficacité d'assimilation
𝜅 𝑋𝑝
_
Efficacité des matières fécales
𝜅 𝑅
_
Efficacité de reproduction
[𝑃 ̇
𝑀 ]
J d
-1 cm
-3
Taux de maintenance somatique spécifique au volume
𝜅̇ 𝐽
d
-1
Coefficient du taux de maintenance de maturité
[𝐸 𝐺 ]
J cm
-3
Coûts spécifiques pour la structure
𝐸 𝐻𝑏
J
Maturité à la naissance
𝐸 𝐻𝑝
J
Maturité à la puberté
ℎ ̇ 𝑎
d
-1
Weibull vieillissement accélération
𝑆 𝐺
_
Coefficient de stress de Gompertz
La procédure d'estimation des paramètres DEB exige dix données d’entrée dites à variation
nulle (Zero variate data) et 6 de pseudo-données (Tab.II.3). Ces pseudo-données sont en fait
des valeurs standard pour une sélection de paramètres DEB et ces valeurs sont tirées de
Kooijman (2010), Tab.2 (Annexe.2).
Les pseudo-données sont utilisées dans la procédure d'ajustement pour éviter les problèmes de
non-convergence.
La fonction de qualité d'ajustement qui est minimisée dans la procédure par Lika et al. (2011)
est une somme pondérée des carrés de la forme :