Partie II
Chapitre VI. Premier signalement d’Ostreopsis spp. (Gonyaulacales,
Dinophyceae) dans une pisciculture méditerranéenne lié à des
troubles de santé : Le genre Ostreopsis dans le sud-ouest du bassin
méditerranéen
Page 85
1. Site d'étude et échantillonnage
Des échantillons d'eau pour l'estimation des abondances de cellules planctoniques sont
prélevés dans un élevage de daurades royales en raceway à la ferme « AQUASOLE»
(35°32,23'N /01°12,07'W), dans le sud-ouest de la Méditerranée (Fig.5). La ferme dispose
d'un système de circulation d'eau ouvert, avec une production moyenne de 200 tonnes .an
-1 .
L'eau de mer ne subit aucun traitement, ni à l'entrée ni à la sortie.
Des prélèvements sont effectués dans les eaux d'entrée (St.1) et dans les eaux de rejet (St. 2),
et dans les eaux de bassin à poisson (St.3) pour vérifier la présence ou l’abscence de genre
Ostreopsis (Annexe 5). L’échantillionnage est effectué, avant l’alimentation des poissons,
bimensuellement pendant l'été 2016 et 2017 (de juin à septembre), à l'aide de bouteilles en
plastique (de 250 ml à 1L) selon les recommandations de (AQUAREF 2015, ISO 56676:2014). Les échantillons d'eau de mer pour le comptage des cellules d'Ostreopsis sont fixés
avec une solution de Lugol à 2% (Mangialajo et al. 2011). Tous les échantillons sont
conservés dans l'obscurité à 4°C et transportés au laboratoire pour une analyse plus
approfondie. La température et la salinité sont déterminées in situ à l'aide d'un capteur
multiparamétrique de la qualité de l'eau de type (Hanna HI 9828, précision 0,18°C pour la
température et 0,05 pour la salinité).
2. Analyses au laboratoire
L'analyse des phosphates, de l'ammoniac, des nitrites, des nitrates et de la chlorophylle-a est
effectuée selon Amouroux and Claisse (2016). Les échantillons d'eau à utiliser pour l'analyse
des nutriments sont immédiatement filtrés par des filtres (Whatman GF/F, porosité = 0,7 μm),
placés dans un congélateur et analysés dans les 24 heures, suivant la méthode colorimétrique
(Chifflet et al. 2004) à l'aide d'un auto-analyseur (SKALAR). Les limites de détectabilité sont
de 0,02 μmol.L
-1 pour les nitrates, les nitrites, l'ammoniac et les orthophosphates. L’azote
inorganique dissous (DIN) = nitrates + nitrites + ammoniac. La chlorophylle-a est estimée à
partir de l'extraction à l'acétone à 90 % dans l'obscurité après filtration sur des filtres (GF/6 de
Whatman, 0,7 µm) (Sun et al. 2016), ensuite, elle est mesurée par spectrophotométrie
Chapitre VI. Premier signalement d’Ostreopsis spp. (Gonyaulacales,
Dinophyceae) dans une pisciculture méditerranéenne lié à des
troubles de santé : Le genre Ostreopsis dans le sud-ouest du bassin
méditerranéen
Page 85
1. Site d'étude et échantillonnage
Des échantillons d'eau pour l'estimation des abondances de cellules planctoniques sont
prélevés dans un élevage de daurades royales en raceway à la ferme « AQUASOLE»
(35°32,23'N /01°12,07'W), dans le sud-ouest de la Méditerranée (Fig.5). La ferme dispose
d'un système de circulation d'eau ouvert, avec une production moyenne de 200 tonnes .an
-1 .
L'eau de mer ne subit aucun traitement, ni à l'entrée ni à la sortie.
Des prélèvements sont effectués dans les eaux d'entrée (St.1) et dans les eaux de rejet (St. 2),
et dans les eaux de bassin à poisson (St.3) pour vérifier la présence ou l’abscence de genre
Ostreopsis (Annexe 5). L’échantillionnage est effectué, avant l’alimentation des poissons,
bimensuellement pendant l'été 2016 et 2017 (de juin à septembre), à l'aide de bouteilles en
plastique (de 250 ml à 1L) selon les recommandations de (AQUAREF 2015, ISO 56676:2014). Les échantillons d'eau de mer pour le comptage des cellules d'Ostreopsis sont fixés
avec une solution de Lugol à 2% (Mangialajo et al. 2011). Tous les échantillons sont
conservés dans l'obscurité à 4°C et transportés au laboratoire pour une analyse plus
approfondie. La température et la salinité sont déterminées in situ à l'aide d'un capteur
multiparamétrique de la qualité de l'eau de type (Hanna HI 9828, précision 0,18°C pour la
température et 0,05 pour la salinité).
2. Analyses au laboratoire
L'analyse des phosphates, de l'ammoniac, des nitrites, des nitrates et de la chlorophylle-a est
effectuée selon Amouroux and Claisse (2016). Les échantillons d'eau à utiliser pour l'analyse
des nutriments sont immédiatement filtrés par des filtres (Whatman GF/F, porosité = 0,7 μm),
placés dans un congélateur et analysés dans les 24 heures, suivant la méthode colorimétrique
(Chifflet et al. 2004) à l'aide d'un auto-analyseur (SKALAR). Les limites de détectabilité sont
de 0,02 μmol.L
-1 pour les nitrates, les nitrites, l'ammoniac et les orthophosphates. L’azote
inorganique dissous (DIN) = nitrates + nitrites + ammoniac. La chlorophylle-a est estimée à
partir de l'extraction à l'acétone à 90 % dans l'obscurité après filtration sur des filtres (GF/6 de
Whatman, 0,7 µm) (Sun et al. 2016), ensuite, elle est mesurée par spectrophotométrie