CHAPITRE II : MATÉRIEL ET MÉTHODES
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Il implique que l’échantillon soit prélevé aléatoirement, d'une communauté indéfiniment large,
et que l’ensemble des espèces de la communauté soit représenté (LEGENDRE et
LENGENDRE, 1979 ; in KABRANE, 2012).
Le recouvrement est proposé comme unité de mesure dans le calcul de l’indice de diversité
(BALLESTEROS, 1992) :
𝐻
′ = − ∑ 𝑝 𝑖 ∙ 𝑙𝑜𝑔 2 ∙ 𝑝 𝑖
𝑇
𝑖=1
Avec
𝑝 𝑖(recouvrement relative de l ′ espèce i) =
𝑅 𝑖
𝑅 𝑇
Il est nécessaire de préciser la base du logarithme utilisée (base 2 - La plus courante -, base 10,
etc…). Cet indice s’exprime en bits par individus (bit/individu), si les logarithmes sont de base
2. L’indice permet d’exprimer la diversité en prenant en compte de nombre d’espèces et de
l’abondance des individus au sein de chacune de ces espèces. Ainsi, une communauté dominée
par une seule espèce aura un coefficient moindre qu’une communauté dont toutes les espèces
sont codominantes.
La valeur de l’indice varie de 0 (une seule espèce, ou bien une espèce dominant très
largement toutes les autres) à log S (lorsque toutes les espèces ont la même
abondance).
𝐻′ 𝑚𝑎𝑥 = log 𝑆 (S= nombre total d’espèces)
La valeur maximal de 𝐻′ 𝑚𝑎𝑥 est de 5 (bit/individu), il dépasse rarement 4.5 bits/individu, même
dans les communautés très diversifiées, et varie généralement entre 1.5, et 3.5 (FRONTIER,
1983).
Leur valeur est relativement basse dans les eaux de transition comme les lagunes, deltas ou estuaires,
même lorsqu’ils ne sont pas perturbés. Il reste ainsi difficile d’en faire un descripteur de l’état d’un
milieu à moins de déterminer au préalable des valeurs seuil pour chaque type d’habitat et pour une
surface échantillonnée donnée, ainsi que l’ont proposé SIMBOURA et ZENETOS (2002).
b) INDICE D’ÉQUITABILITÉ (𝑬) :
Pour comparer la structure de plusieurs peuplements, l’indice de SHANNON est souvent
accompagné de l’indice l’Equitabilité (PIELOU, 1977) ou Régularité (FRONTIER