Chapitre II
Matériel et méthodes
14
fondamentaux dans la répartition de l’énergie, qui justifient l’introduction de seuils de transition
non standard (Jusup et al., 2011).
La spécification détaillée de tous les flux d'énergie est obtenue par le modèle "abj", qui est une
extension au modèle DEB standard, il prend en compte l'accélération de la croissance au stade
larvaire, le ralentissement de la croissance au début de la phase juvénile, des modifications de la
forme du corps et des effets de la température sur les taux métaboliques (Jusup et al., 2011).
L'accélération métabolique tient compte du changement de forme observé et de l'observation
empirique selon laquelle la longueur augmente de manière approximativement exponentielle avec
l'âge au cours du stade juvénile précoce pour la plupart des espèces de poissons. Le modèle abjDEB a déjà été utilisé pour modéliser de nombreux Perciformes méditerranéens (Pecquerie,
Petitgas and Kooijman, 2009; Augustine et al., 2011; Jusup et al., 2011; Lika, Kooijman and
Papandroulakis, 2014).
2.2. Définition des paramètres DEB
En utilisant plusieurs ensembles de données de l'histoire de vie d’un individu (paramètre de
croissance et de reproduction), quelques paramètres du modèle DEB sont estimés selon une
procédure décrite par (Lika et al., 2011). Les paramètres DEB restants, ont été définis sur des
valeurs prédéfinies tirées de Kooijman (2010).
Le tableau II.1 regroupe l’appellation et désignation des paramètres que nous allons estimer dans
notre étude.
Tableau II.1. Définition des paramètres du modèle DEB standard (Meer et al, 2014).
Paramètre
Unité
Désignation
í µí±í µí°´
K
Température d'Arrhenius
í µí±
_
Réponse fonctionnelle échelonnée
í µí±§
Facteur de zoom
í µí»¿í µí±
_
Paramètre de forme
í µí±£̇
cm d-1
Conductance énergétique
í µí¼
Fraction d'allocation en soma
í µí¼ í µí±
_
Efficacité d'assimilation
í µí¼ í µí±í µí±
_
Efficacité des matières fécales
í µí¼ í µí±
_
Efficacité de reproduction
[í µí± ̇ M]
J d-1 cm-3
Taux de maintenance somatique spécifique au volume
κ̇ í µí°½
d-1
Coefficient du taux de maintenance de maturité
[í µí°¸í µí°º]
J cm-3
Coûts spécifiques pour la structure
í µí°¸ í µí°»
í µí±
J
Maturité à la naissance
í µí°¸ í µí°»
í µí±
J
Maturité à la puberté
ℎ ̇ í µí±
d-1
Weibull vieillissement accélération
Matériel et méthodes
14
fondamentaux dans la répartition de l’énergie, qui justifient l’introduction de seuils de transition
non standard (Jusup et al., 2011).
La spécification détaillée de tous les flux d'énergie est obtenue par le modèle "abj", qui est une
extension au modèle DEB standard, il prend en compte l'accélération de la croissance au stade
larvaire, le ralentissement de la croissance au début de la phase juvénile, des modifications de la
forme du corps et des effets de la température sur les taux métaboliques (Jusup et al., 2011).
L'accélération métabolique tient compte du changement de forme observé et de l'observation
empirique selon laquelle la longueur augmente de manière approximativement exponentielle avec
l'âge au cours du stade juvénile précoce pour la plupart des espèces de poissons. Le modèle abjDEB a déjà été utilisé pour modéliser de nombreux Perciformes méditerranéens (Pecquerie,
Petitgas and Kooijman, 2009; Augustine et al., 2011; Jusup et al., 2011; Lika, Kooijman and
Papandroulakis, 2014).
2.2. Définition des paramètres DEB
En utilisant plusieurs ensembles de données de l'histoire de vie d’un individu (paramètre de
croissance et de reproduction), quelques paramètres du modèle DEB sont estimés selon une
procédure décrite par (Lika et al., 2011). Les paramètres DEB restants, ont été définis sur des
valeurs prédéfinies tirées de Kooijman (2010).
Le tableau II.1 regroupe l’appellation et désignation des paramètres que nous allons estimer dans
notre étude.
Tableau II.1. Définition des paramètres du modèle DEB standard (Meer et al, 2014).
Paramètre
Unité
Désignation
í µí±í µí°´
K
Température d'Arrhenius
í µí±
_
Réponse fonctionnelle échelonnée
í µí±§
Facteur de zoom
í µí»¿í µí±
_
Paramètre de forme
í µí±£̇
cm d-1
Conductance énergétique
í µí¼
Fraction d'allocation en soma
í µí¼ í µí±
_
Efficacité d'assimilation
í µí¼ í µí±í µí±
_
Efficacité des matières fécales
í µí¼ í µí±
_
Efficacité de reproduction
[í µí± ̇ M]
J d-1 cm-3
Taux de maintenance somatique spécifique au volume
κ̇ í µí°½
d-1
Coefficient du taux de maintenance de maturité
[í µí°¸í µí°º]
J cm-3
Coûts spécifiques pour la structure
í µí°¸ í µí°»
í µí±
J
Maturité à la naissance
í µí°¸ í µí°»
í µí±
J
Maturité à la puberté
ℎ ̇ í µí±
d-1
Weibull vieillissement accélération