Chapitre II
Matériel et méthodes
12
Dans le cadre du présent travail, nous appliquons la théorie DEB à la modélisation du cycle de vie
d’un poisson. La théorie DEB propose un modèle de croissance basée sur des règles de prise de
nourriture et d’utilisation de l’énergie assimilée en fonction des conditions de nourriture et de
température vécues par un individu.
Les processus clés de la théorie DEB sont l’ingestion, la digestion, la mise en réserve de l’énergie
assimilée, la maintenance, la croissance, le développement et la reproduction. Trois stades de vie
sont distingués :
• L’embryon, qui ne se nourrit ni ne se reproduit ;
• Le juvénile, qui se nourrit mais ne se reproduit pas ;
• L’adulte qui se nourrit et se reproduit.
2.1. Définition des variables du modèle DEB
Selon Pecquerie (2007), un individu est représenté par quatre entités (variables d’état) : la
structure, la réserve, la maturité et le compartiment de reproduction.
• La structure désigne l’ensemble des constituants de l’organisme qui sont nécessaires à son
fonctionnement et nécessitent un entretien (dégradation-synthèse des protéines par
exemple) ;
• La réserve désigne l’ensemble des constituants de l’organisme disponibles pour un usage
métabolique. Ce terme ne désigne pas une quantité de matière stockée pour une utilisation
future ;
• La maturité ne concerne pas seulement le système reproducteur. Le système immunitaire
et le système hormonal par exemple sont des éléments que l’individu acquiert au cours de
son développement. Aux stades embryon et juvénile, la structure et la réserve participent
au poids de l’individu tandis que la maturité correspond à une énergie dissipée. Elle a le
statut d’acquérir la capacité de se reproduire au stade adulte ;
• Dans le compartiment reproduction, au stade adulte, l’individu stocke de l’énergie. Ce
compartiment contribue également au poids de l’individu et à la même composition que la
réserve.
La composition des compartiments structure et la réserve est constante, il s’agit de l’une des règles
de la théorie DEB. Cependant, la composition totale de l’individu peut varier en fonction des
conditions environnementales rencontrées, mais lorsque les conditions sont constantes, le ratio
réserve sur structure reste constant ; il s’agit de l’hypothèse d’homéostasie faible. Ce ratio définit
la densité de réserve de l’individu, qui est une notion importante de la théorie (Pecquerie, 2007).
Matériel et méthodes
12
Dans le cadre du présent travail, nous appliquons la théorie DEB à la modélisation du cycle de vie
d’un poisson. La théorie DEB propose un modèle de croissance basée sur des règles de prise de
nourriture et d’utilisation de l’énergie assimilée en fonction des conditions de nourriture et de
température vécues par un individu.
Les processus clés de la théorie DEB sont l’ingestion, la digestion, la mise en réserve de l’énergie
assimilée, la maintenance, la croissance, le développement et la reproduction. Trois stades de vie
sont distingués :
• L’embryon, qui ne se nourrit ni ne se reproduit ;
• Le juvénile, qui se nourrit mais ne se reproduit pas ;
• L’adulte qui se nourrit et se reproduit.
2.1. Définition des variables du modèle DEB
Selon Pecquerie (2007), un individu est représenté par quatre entités (variables d’état) : la
structure, la réserve, la maturité et le compartiment de reproduction.
• La structure désigne l’ensemble des constituants de l’organisme qui sont nécessaires à son
fonctionnement et nécessitent un entretien (dégradation-synthèse des protéines par
exemple) ;
• La réserve désigne l’ensemble des constituants de l’organisme disponibles pour un usage
métabolique. Ce terme ne désigne pas une quantité de matière stockée pour une utilisation
future ;
• La maturité ne concerne pas seulement le système reproducteur. Le système immunitaire
et le système hormonal par exemple sont des éléments que l’individu acquiert au cours de
son développement. Aux stades embryon et juvénile, la structure et la réserve participent
au poids de l’individu tandis que la maturité correspond à une énergie dissipée. Elle a le
statut d’acquérir la capacité de se reproduire au stade adulte ;
• Dans le compartiment reproduction, au stade adulte, l’individu stocke de l’énergie. Ce
compartiment contribue également au poids de l’individu et à la même composition que la
réserve.
La composition des compartiments structure et la réserve est constante, il s’agit de l’une des règles
de la théorie DEB. Cependant, la composition totale de l’individu peut varier en fonction des
conditions environnementales rencontrées, mais lorsque les conditions sont constantes, le ratio
réserve sur structure reste constant ; il s’agit de l’hypothèse d’homéostasie faible. Ce ratio définit
la densité de réserve de l’individu, qui est une notion importante de la théorie (Pecquerie, 2007).