chapitre 26 La phylogenèse et l’arbre de la vie 639
• À moins que la longueur des branches soit proportionnelle au temps
écoulé ou à la quantité de mutations génétiques, un arbre phylogénétique n’indique que des modèles de descendance.
• L’histoire évolutive d’une espèce nous renseigne beaucoup à son sujet ;
en fait, la phylogenèse trouve de nombreuses applications utiles.
Les humains et les chimpanzés sont des groupes frères.
Expliquez ce que signifie cette phrase.
ConCept
26.2
la phylogenèse repose sur des données
morphologiques et moléculaires (p. 623 à 626)
• Les organismes qui possèdent des morphologies ou des séquences
d’ADN très semblables sont susceptibles d’être plus étroitement
apparentés que les organismes ayant des structures et des séquences
génétiques très différentes.
• Pour déduire la phylogenèse, il importe de distinguer l’homologie
(ressemblance imputable à un ancêtre commun) de l’analogie
(ressemblance imputable à une évolution convergente).
• Des logiciels permettent d’aligner des séquences d’ADN comparables
et de distinguer les homologies moléculaires des correspondances
accidentelles entre des taxons qui ont divergé depuis longtemps.
Pourquoi est-il nécessaire de distinguer l’homologie de l’analogie
pour prédire une phylogenèse ?
ConCept
26.3
les arbres phylogénétiques sont construits
à partir de caractères communs (p. 626 à 632)
• Un clade est un taxon monophylétique qui comprend un ancêtre
et tous ses descendants.
• Les clades sont définis en fonction de leurs caractères dérivés
communs.
A
C
Groupe
monophylétique
Groupe polyphylétique
Groupe paraphylétique
D
E
F
G
B
A
C
D
E
F
G
B
A
C
D
E
F
G
B
• La longueur d’une ramification peut refléter le nombre de changements évolutifs survenus ou la période écoulée.
• Parmi les hypothèses phylogénétiques, celle de l’arbre le plus simple
nécessite le moins de changements au cours de l’évolution, et celle
de l’arbre le plus probable est basée sur le type de changements
le plus plausible.
• Les meilleures théories phylogénétiques sont celles qui intègrent
la plus grande variété de données.
Quelle logique sous-tend l’utilisation de caractères dérivés
communs pour formuler une hypothèse phylogénétique ?
ConCept
26.4
le génome recèle l’histoire évolutive de tout organisme
(p. 632 et 633)
• Les gènes orthologues sont des gènes homologues trouvés dans
des espèces différentes du fait de la spéciation. Les gènes paralogues
sont des gènes homologues présents au sein d’une espèce à la suite
d’une duplication. Ces gènes peuvent diverger et remplir de nouvelles
fonctions.
Pour reconstituer une phylogenèse, vaut-il mieux comparer les gènes
hortologues ou les gènes paralogues ? Expliquez votre réponse.
ConCept
26.5
les horloges moléculaires rendent compte du temps
de l’évolution (p. 633 à 635)
• Certaines régions de l’ADN évoluent à une vitesse suffisamment
constante pour constituer de véritables horloges moléculaires,
selon lesquelles l’accumulation des modifications génétiques sert
à estimer le moment où se sont produits les changements évolutifs.
D’autres gènes, cependant, changent d’une manière moins prévisible.
• Une analyse réalisée au moyen d’une horloge moléculaire donne à
penser que la souche la plus commune du VIH est passée des primates
aux humains dans les années 1930.
Décrivez certaines présomptions et limites des horloges moléculaires.
ConCept
26.6
de nouvelles données enrichissent continuellement
notre compréhension de l’arbre de la vie
(p. 636 à 638)
• Les systèmes de classification antérieurs ont cédé le pas à la vision
actuelle de l’arbre de la vie, qui comprend trois grands domaines :
les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes.
• Selon les phylogenèses construites à partir de gènes d’ARNr, les Eucaryotes seraient plus étroitement apparentés aux Archées, alors que des
données provenant d’autres gènes indiquent des liens plus étroits
avec les Bactéries.
• D’autres analyses génétiques indiquent que les Eucaryotes seraient
issus de la fusion d’une bactérie et d’une archée, et on pourrait illustrer
cette hypothèse par un « cercle de la vie », où les Eucaryotes seraient
étroitement apparentés à la fois aux Bactéries et aux Archées.
Pourquoi a-t-on abandonné le système à cinq règnes au profit
d’un système à trois domaines ?
évaLuation
niveau 1 : connaissances et compréhension
1. Dans la figure 26.4, quel groupe taxinomique descend du même
ancêtre que les Canidés ?
a) Les Félidés.
d) Canis.
b) Les Mustélidés.
e) Lutra.
c) Les Carnivores.
2. Les trois espèces vivantes X, Y et Z ont un ancêtre commun,
appelé T, qui est également l’ancêtre commun des espèces
disparues U et V. Le groupement des espèces T, X, Y et Z
(excluant U et V) forme :
a) un taxon valide.
d) un groupe polyphylétique.
b) un clade monophylétique.
e) un groupe intérieur à comparer
c) un groupe paraphylétique.
avec l’espèce U du groupe
extérieur.
?
?
?
?
?
?
• À moins que la longueur des branches soit proportionnelle au temps
écoulé ou à la quantité de mutations génétiques, un arbre phylogénétique n’indique que des modèles de descendance.
• L’histoire évolutive d’une espèce nous renseigne beaucoup à son sujet ;
en fait, la phylogenèse trouve de nombreuses applications utiles.
Les humains et les chimpanzés sont des groupes frères.
Expliquez ce que signifie cette phrase.
ConCept
26.2
la phylogenèse repose sur des données
morphologiques et moléculaires (p. 623 à 626)
• Les organismes qui possèdent des morphologies ou des séquences
d’ADN très semblables sont susceptibles d’être plus étroitement
apparentés que les organismes ayant des structures et des séquences
génétiques très différentes.
• Pour déduire la phylogenèse, il importe de distinguer l’homologie
(ressemblance imputable à un ancêtre commun) de l’analogie
(ressemblance imputable à une évolution convergente).
• Des logiciels permettent d’aligner des séquences d’ADN comparables
et de distinguer les homologies moléculaires des correspondances
accidentelles entre des taxons qui ont divergé depuis longtemps.
Pourquoi est-il nécessaire de distinguer l’homologie de l’analogie
pour prédire une phylogenèse ?
ConCept
26.3
les arbres phylogénétiques sont construits
à partir de caractères communs (p. 626 à 632)
• Un clade est un taxon monophylétique qui comprend un ancêtre
et tous ses descendants.
• Les clades sont définis en fonction de leurs caractères dérivés
communs.
A
C
Groupe
monophylétique
Groupe polyphylétique
Groupe paraphylétique
D
E
F
G
B
A
C
D
E
F
G
B
A
C
D
E
F
G
B
• La longueur d’une ramification peut refléter le nombre de changements évolutifs survenus ou la période écoulée.
• Parmi les hypothèses phylogénétiques, celle de l’arbre le plus simple
nécessite le moins de changements au cours de l’évolution, et celle
de l’arbre le plus probable est basée sur le type de changements
le plus plausible.
• Les meilleures théories phylogénétiques sont celles qui intègrent
la plus grande variété de données.
Quelle logique sous-tend l’utilisation de caractères dérivés
communs pour formuler une hypothèse phylogénétique ?
ConCept
26.4
le génome recèle l’histoire évolutive de tout organisme
(p. 632 et 633)
• Les gènes orthologues sont des gènes homologues trouvés dans
des espèces différentes du fait de la spéciation. Les gènes paralogues
sont des gènes homologues présents au sein d’une espèce à la suite
d’une duplication. Ces gènes peuvent diverger et remplir de nouvelles
fonctions.
Pour reconstituer une phylogenèse, vaut-il mieux comparer les gènes
hortologues ou les gènes paralogues ? Expliquez votre réponse.
ConCept
26.5
les horloges moléculaires rendent compte du temps
de l’évolution (p. 633 à 635)
• Certaines régions de l’ADN évoluent à une vitesse suffisamment
constante pour constituer de véritables horloges moléculaires,
selon lesquelles l’accumulation des modifications génétiques sert
à estimer le moment où se sont produits les changements évolutifs.
D’autres gènes, cependant, changent d’une manière moins prévisible.
• Une analyse réalisée au moyen d’une horloge moléculaire donne à
penser que la souche la plus commune du VIH est passée des primates
aux humains dans les années 1930.
Décrivez certaines présomptions et limites des horloges moléculaires.
ConCept
26.6
de nouvelles données enrichissent continuellement
notre compréhension de l’arbre de la vie
(p. 636 à 638)
• Les systèmes de classification antérieurs ont cédé le pas à la vision
actuelle de l’arbre de la vie, qui comprend trois grands domaines :
les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes.
• Selon les phylogenèses construites à partir de gènes d’ARNr, les Eucaryotes seraient plus étroitement apparentés aux Archées, alors que des
données provenant d’autres gènes indiquent des liens plus étroits
avec les Bactéries.
• D’autres analyses génétiques indiquent que les Eucaryotes seraient
issus de la fusion d’une bactérie et d’une archée, et on pourrait illustrer
cette hypothèse par un « cercle de la vie », où les Eucaryotes seraient
étroitement apparentés à la fois aux Bactéries et aux Archées.
Pourquoi a-t-on abandonné le système à cinq règnes au profit
d’un système à trois domaines ?
évaLuation
niveau 1 : connaissances et compréhension
1. Dans la figure 26.4, quel groupe taxinomique descend du même
ancêtre que les Canidés ?
a) Les Félidés.
d) Canis.
b) Les Mustélidés.
e) Lutra.
c) Les Carnivores.
2. Les trois espèces vivantes X, Y et Z ont un ancêtre commun,
appelé T, qui est également l’ancêtre commun des espèces
disparues U et V. Le groupement des espèces T, X, Y et Z
(excluant U et V) forme :
a) un taxon valide.
d) un groupe polyphylétique.
b) un clade monophylétique.
e) un groupe intérieur à comparer
c) un groupe paraphylétique.
avec l’espèce U du groupe
extérieur.
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