Matériel et méthodes
Afin de déterminer la proportionnalité du pigment chlorophyllien par rapport à la fluorescence totale,
le rapport (Chl-a
HPLC
/ Fluo
CTD
) est calculé à chaque profondeur dans toutes les stations de mesures insitu. Par la suite, une moyenne de ces rapports est estimée sur des intervalles de profondeurs présentés
sur le Tableau 3. Les résultats des ratios moyens sont présentés sur la Figure 19.
Tableau 3: Division de la colonne d'eau en plusieurs classes de profondeurs par rapport aux prélèvements in-situ
Classe de profondeur
1
2
3
4
5
6
7
8
Intervalle de profondeur 10 m 20-35 m 40-45 m 50-55 m 60-65 m 70-75 m 80-85 m 90-100 m
La profondeur est considérée comme un proxy de la lumière. En effet, les moyennes des rapports
représentent un gradient surface-fond (Figure 19). Ce gradient est expliqué par la présence des NonPhotochemical Quenching (NPQ) (Quenching non photochimique) qui représentent un important
problème pour l’estimation de la Chl-a
F
(Cullen et Lewis, 1995). Il existe plusieurs méthodes pour
corriger l’effet de NPQ (Behrenfeld et Boss, 2006 ; Sackmann et al., 2008 ; Xing et al., 2012). Dans
notre travail, une division de la colonne d’eau en fonction de la stabilité des rapports a été effectuée
(Figure 19). En effet, 3 classes de profondeur ont été déterminées sous le nom d’Indice Quenching de
la Chlorophylle « Chlorophyll Quenching Index » (CQI) (Tableau 4). Chaque classe peut être sensible
aux effets des NPQ « Non-Photochemical Quenching » . Cette sensibilité décroît avec la profondeur
(Figure 19), c’est-à-dire avec la diminution de la lumière.
Afin de mieux éliminer les effets des NPQ, nous avons appliqué les 2 méthodes OLS et LAD sur les
données de chaque classe séparément pour calculer les valeurs de Chl-a
F
. Par ailleurs, le standard
63
Figure 19: La variabilité de la Chl-a
HPLC et Fluo
CTD : (a) La variabilité du ratio (Chl-a
HPLC / Fluo
CTD ) en fonction de la
profondeur. (b) Les données Chl-a
HPLC et Fluo
CTD en fonction de la profondeur (station : 37,097 °N et 3,242° E). Cette
figure est générée en utilisant le logiciel libre R (version 3.4.4 (2018-03-15), https://cran.r-project.org/ )
0
0.2 0.4 0.6 0.8
1
1.2 1.4
0
20
40
60
80
100
120
140
160
180
200
Depth (m)
Chl-a
Chl-a
HPLC (mg m
-3
)
Chl-a
CTD (µg l
-1
)
a)
b)
Afin de déterminer la proportionnalité du pigment chlorophyllien par rapport à la fluorescence totale,
le rapport (Chl-a
HPLC
/ Fluo
CTD
) est calculé à chaque profondeur dans toutes les stations de mesures insitu. Par la suite, une moyenne de ces rapports est estimée sur des intervalles de profondeurs présentés
sur le Tableau 3. Les résultats des ratios moyens sont présentés sur la Figure 19.
Tableau 3: Division de la colonne d'eau en plusieurs classes de profondeurs par rapport aux prélèvements in-situ
Classe de profondeur
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Intervalle de profondeur 10 m 20-35 m 40-45 m 50-55 m 60-65 m 70-75 m 80-85 m 90-100 m
La profondeur est considérée comme un proxy de la lumière. En effet, les moyennes des rapports
représentent un gradient surface-fond (Figure 19). Ce gradient est expliqué par la présence des NonPhotochemical Quenching (NPQ) (Quenching non photochimique) qui représentent un important
problème pour l’estimation de la Chl-a
F
(Cullen et Lewis, 1995). Il existe plusieurs méthodes pour
corriger l’effet de NPQ (Behrenfeld et Boss, 2006 ; Sackmann et al., 2008 ; Xing et al., 2012). Dans
notre travail, une division de la colonne d’eau en fonction de la stabilité des rapports a été effectuée
(Figure 19). En effet, 3 classes de profondeur ont été déterminées sous le nom d’Indice Quenching de
la Chlorophylle « Chlorophyll Quenching Index » (CQI) (Tableau 4). Chaque classe peut être sensible
aux effets des NPQ « Non-Photochemical Quenching » . Cette sensibilité décroît avec la profondeur
(Figure 19), c’est-à-dire avec la diminution de la lumière.
Afin de mieux éliminer les effets des NPQ, nous avons appliqué les 2 méthodes OLS et LAD sur les
données de chaque classe séparément pour calculer les valeurs de Chl-a
F
. Par ailleurs, le standard
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Figure 19: La variabilité de la Chl-a
HPLC et Fluo
CTD : (a) La variabilité du ratio (Chl-a
HPLC / Fluo
CTD ) en fonction de la
profondeur. (b) Les données Chl-a
HPLC et Fluo
CTD en fonction de la profondeur (station : 37,097 °N et 3,242° E). Cette
figure est générée en utilisant le logiciel libre R (version 3.4.4 (2018-03-15), https://cran.r-project.org/ )
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140
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Depth (m)
Chl-a
Chl-a
HPLC (mg m
-3
)
Chl-a
CTD (µg l
-1
)
a)
b)