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eucaryote photosynthétique (une algue), il est aussi évident que différentes autres lignées photosynthétiques sont issues d’endosymbioses secondaires, voire tertiaires, impliquant différentes lignées d’organismes unicellulaires hétérotrophes phagocytant des eucaryotes déjà photosynthétiques. Un des apports des
analyses de séquences d’ADN nucléaires a été de révéler les groupes frères non photosynthétiques pour
les différents groupes chlorophylliens au-delà des divergences évolutives et donc morphologiques liées à
des modes de nutrition différents chez les groupes frères. La multiplicité des phénomènes d’endosymbiose explique donc aisément l’apparition de différentes lignées eucaryotes photosynthétiques, donc
végétales, mais ne présentant pas d’ancêtre commun, donc polyphylétiques.
Les organismes décrits dans cet ouvrage ont donc été classifiés depuis des siècles par les botanistes
sur des critères essentiellement morphologiques. Même si les classifications issues de ces études sont
parfois remises en cause actuellement, leur pertinence et leur utilité demeurent puisque même si elles ne
reflètent, dans le pire des cas, que des stratégies adaptatives communes conduisant à des convergences
morphologiques et physiologiques d’organismes évolutivement distants, elles permettent d’utiles
regroupements notamment lors d’étude de terrain. Ainsi, les algues, organismes photosynthétiques
généralement inféodés aux milieux aquatiques, ne constituent pas un groupe monophylétique mais rassemble des organismes assez semblables pour que l’on ait besoin d’un nom pour les désigner. De
même, les champignons bien que non photosynthétiques sont classiquement étudiés par les botanistes
du fait de la ressemblance de leurs cellules avec les cellules végétales et de leur immobilité. S’il est évident depuis longtemps que les champignons et les plantes chlorophylliennes ne peuvent pas constituer
un groupe monophylétique, ce n’est que plus récemment qu’il est admis que le groupe des champignons
n’est lui-même pas monophylétique mais rassemble des « champignons vrais » ou Eumycètes et des
Oomycètes, proches d’algues brunes hétérocontées, sur des critères morphologiques, fins filaments de
cellules pourvues d’une paroi et d’une vacuole, liés là encore à une convergence évolutive due à leur
mode de nutrition par absorption.
Les classifications anciennes n’ont donc pas toujours rassemblé des groupes monophylétiques mais
ont créé des regroupements encore forts utiles pour décrire les organismes et leur diversité comme cela
est proposé dans cet Atlas de Biologie Végétale depuis bientôt trente années.
Euglenoidea
Rhodophyta
Chrysophyta
Streptophyta
EUMYCOTA
ANIMALIA
= METAZOA
Kinetoplastida
Dinophyta
Apicomplexa
Ciliophora
EUGLENOZOA
ALVEOLATA
HETEROKONTA
= STRAMENOPILES
CHLOROBIONTA
RHODOBIONTA
Chlorophyta
Ochrophyta
Oomycota
CERCOZOA
Chlorarachyniophyta
Monadofilosa
Groupes
photosynthétiques
Champignons
Glaucophyta
Cryptophyta
Haptophyta
MYCETOZOA
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