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4 • Variabilité génotypique et variabilité phénotypique
Figure 30 Polymorphisme de répétition : microsatellites.
Les microsatellites sont constitués par des séquences courtes répétitives,
formant des sortes de blocs. Le polymorphisme réside dans le nombre de
répétitions, mais pas dans la séquence elle-même. On voit ici de haut en bas :
– deux allèles situés sur une paire de chromosomes, l’un est dû à la répétition
5 fois du tandem CA [(CA) 5 ], dans l’autre allèle le motif est répété 7 fois
[(CA) 7 ]. Ces microsatellites sont encadrés par des séquences identiques dans
les deux allèles (ici arbitrairement GGT et AAAC. On voit également la
séquence antisens appariée, elle est formée d’un microsatellite (TG) 5 sur
l’allèle 1 et (TG) 7 sur l’allèle 2, flanquées des séquences CCA et TTTG,
− les mêmes séquences sont ici étalées, elles seront hybridées avec des amorces-PCR complémentaires des séquences flanquantes GGT et AAAC (en pratique ces amorces sont, bien entendu, plus longues), ➥
4 • Variabilité génotypique et variabilité phénotypique
Figure 30 Polymorphisme de répétition : microsatellites.
Les microsatellites sont constitués par des séquences courtes répétitives,
formant des sortes de blocs. Le polymorphisme réside dans le nombre de
répétitions, mais pas dans la séquence elle-même. On voit ici de haut en bas :
– deux allèles situés sur une paire de chromosomes, l’un est dû à la répétition
5 fois du tandem CA [(CA) 5 ], dans l’autre allèle le motif est répété 7 fois
[(CA) 7 ]. Ces microsatellites sont encadrés par des séquences identiques dans
les deux allèles (ici arbitrairement GGT et AAAC. On voit également la
séquence antisens appariée, elle est formée d’un microsatellite (TG) 5 sur
l’allèle 1 et (TG) 7 sur l’allèle 2, flanquées des séquences CCA et TTTG,
− les mêmes séquences sont ici étalées, elles seront hybridées avec des amorces-PCR complémentaires des séquences flanquantes GGT et AAAC (en pratique ces amorces sont, bien entendu, plus longues), ➥