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3 • Données de base et sémantique élémentaire
ques avec lesquelles je suis fait (ou faite) ressemblent à celles dont mes
parents sont faits et à celles dont les autres humains sont faits, et cette
ressemblance m’a été transmise, lors de la conception. La morphologie
d’un être et ses principales fonctions vitales sont l’expression de sa
composition en protéines et la fonction des protéines dépend de leur
arrangement spatial. La structure chimique des protéines, c’est-à-dire
leur composition en acides aminés, ne détermine pas directement leur
arrangement spatial (c’est-à-dire leur structure tertiaire). Le repliement
de la chaîne des protéines ne se fait pas en fait au hasard, par essais successifs, comme l’avait postulé Anfinsen à propos de la ribonucléase
pancréatique. Cela est vrai dans les conditions définies dans l’expérience d’Anfinsen, mais ce n’est pas vrai d’une façon générale in vivo
dans le cytoplasme, ou… dans le canal biliaire, dont la composition
n’est pas la même que celle de l’eau ou du tampon utilisé par Anfinsen.
L’arrangement spatial des protéines se fait selon un programme qui
dicte la façon dont le repliement de la séquence primaire doit se faire
pour aboutir à la structure tertiaire finale, et donc à la fonction. Ce
processus est guidé à la fois par l’environnement où se trouve la protéine (protéines voisines, structure cellulaire) et par des protéines auxiliaires – les protéines-chaperons – qui indiquent la façon dont ce
repliement doit se faire. Ces protéines-chaperons 1 agissent un peu à la
façon d’un métier à tisser, mais le processus exact par lequel elles fonctionnent est encore mal connu. Les protéines-chaperons évitent la perte
de temps, et d’énergie, que représente l’exploration de toutes les conformations rendues possibles par la structure primaire, leur présence
explique pourquoi les macroprotéines d’un organisme donné ont un
certain nombre de points en commun.
La séquence primaire se transmet héréditairement, sous forme d’un
code génétique. Le code génétique est lui-même constitué par un
arrangement chimique particulier de l’Acide Désoxyribonucléique, ADN.
Le Génotype c’est ce code, c’est la constitution génétique d’un indi1. Les principales protéines chaperons, ou chaperonines, sont les heat-shock proteins,
HSP, HSP 70 en particulier, et le complexe GroE (ou HSP60/HSP10).
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