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42 Protéines :conformation,structure
tertiaire,notiondedomaine
Mots clés
Hélices alpha, feuillets bêta, boucle, repliement, domaine
1. STRUCTURE TERTIAIRE ET CONFORMATION
La structure tertiaire d’une protéine correspond à la conformation qu’adopent les
éléments de structure secondaire dans l’espace. Également nommée structure tridimentionnelle ou 3D, elle dépend non seulement de la séquence en acides aminés, mais
également des conditions environnementales.
Illustration de l’organisation en structure tertiaire d’une protéine
Les cylindres représentent des hélices a ; les flèches des brins b,
la pointe indiquant l’extrémité carboxy-terminale.
La structure tertiaire est une caractéristique plutôt associée aux protéines globulaires
au niveau desquelles, des segments de chaîne polypeptidique se replient et créent des
liaisons faibles (forces intermoléculaires, fiche 9) et des ponts disulfure entre des résidus
cystéine. L’établissement des liaisons fait diminuer l’enthalpie libre de la structure, ce qui
la stabilise. Dans cette structure, les chaînes latérales polaires intéragissent entre elles ou
avec le solvant alors que les chaînes latérales hydrophobes ont tendance à se retrouver à
l’intérieur de la structure.
2. DOMAINES STRUCTURAUX
Lorsqu’une protéine globulaire possède plus de 200 résidus, elle se replie en domaines
(deux ou plus) qui vont avoir une fonction spécifique pour l’activité de la protéine
(domaine de liaison à un substrat, domaine catalytique, etc.). Des protéines qui partagent
des domaines fonctionnels équivalents font partie d’une même famille protéique. Sur la
base de leur structure, on classe les domaines en 4 groupes.
9782100724185-Livre.indb 100
20/05/15 19:11
42 Protéines :conformation,structure
tertiaire,notiondedomaine
Mots clés
Hélices alpha, feuillets bêta, boucle, repliement, domaine
1. STRUCTURE TERTIAIRE ET CONFORMATION
La structure tertiaire d’une protéine correspond à la conformation qu’adopent les
éléments de structure secondaire dans l’espace. Également nommée structure tridimentionnelle ou 3D, elle dépend non seulement de la séquence en acides aminés, mais
également des conditions environnementales.
Illustration de l’organisation en structure tertiaire d’une protéine
Les cylindres représentent des hélices a ; les flèches des brins b,
la pointe indiquant l’extrémité carboxy-terminale.
La structure tertiaire est une caractéristique plutôt associée aux protéines globulaires
au niveau desquelles, des segments de chaîne polypeptidique se replient et créent des
liaisons faibles (forces intermoléculaires, fiche 9) et des ponts disulfure entre des résidus
cystéine. L’établissement des liaisons fait diminuer l’enthalpie libre de la structure, ce qui
la stabilise. Dans cette structure, les chaînes latérales polaires intéragissent entre elles ou
avec le solvant alors que les chaînes latérales hydrophobes ont tendance à se retrouver à
l’intérieur de la structure.
2. DOMAINES STRUCTURAUX
Lorsqu’une protéine globulaire possède plus de 200 résidus, elle se replie en domaines
(deux ou plus) qui vont avoir une fonction spécifique pour l’activité de la protéine
(domaine de liaison à un substrat, domaine catalytique, etc.). Des protéines qui partagent
des domaines fonctionnels équivalents font partie d’une même famille protéique. Sur la
base de leur structure, on classe les domaines en 4 groupes.
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