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7.1 • Parcimonie
Figure 7.1 – Alignement multiple de séquences et scénario possible pour
leur évolution.
Un alignement multiple de six séquences d’ADN (à gauche) est placé aux feuilles
d’une topologie d’arbre à six feuilles. Les séquences ancestrales (en gris) à côté
des nœuds internes constituent un scénario d’évolution qui induit des changements sur certaines branches indiqués par des ronds. Le coût total de ce scénario
est de 10.
Figure 7.2 – Un arbre phylogénétique étiqueté avec les résidus observés en
un site.
Les résidus du site central de l’alignement de la figure 7.1 sont placés aux feuilles
de l’arbre. L’algorithme de Fitch travaille sur des données de cette nature. Son
objectif est de calculer le nombre minimal de changements dans cet arbre compatible avec l’ensemble des résidus aux feuilles.
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7.1 • Parcimonie
Figure 7.1 – Alignement multiple de séquences et scénario possible pour
leur évolution.
Un alignement multiple de six séquences d’ADN (à gauche) est placé aux feuilles
d’une topologie d’arbre à six feuilles. Les séquences ancestrales (en gris) à côté
des nœuds internes constituent un scénario d’évolution qui induit des changements sur certaines branches indiqués par des ronds. Le coût total de ce scénario
est de 10.
Figure 7.2 – Un arbre phylogénétique étiqueté avec les résidus observés en
un site.
Les résidus du site central de l’alignement de la figure 7.1 sont placés aux feuilles
de l’arbre. L’algorithme de Fitch travaille sur des données de cette nature. Son
objectif est de calculer le nombre minimal de changements dans cet arbre compatible avec l’ensemble des résidus aux feuilles.